More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0688 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
263 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  96.58 
 
 
263 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  96.58 
 
 
274 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  96.58 
 
 
274 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  96.58 
 
 
274 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  96.58 
 
 
274 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  96.58 
 
 
274 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  96.58 
 
 
274 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  86.92 
 
 
260 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  86.59 
 
 
260 aa  407  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  86.15 
 
 
260 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  86.21 
 
 
260 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  85.77 
 
 
260 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  85.11 
 
 
262 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  86.15 
 
 
260 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  83.46 
 
 
260 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  82.38 
 
 
260 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  84.05 
 
 
263 aa  367  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  60.69 
 
 
264 aa  288  5.0000000000000004e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  46.01 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  44.98 
 
 
304 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  42.91 
 
 
288 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  42.91 
 
 
288 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  42.91 
 
 
288 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  45.2 
 
 
270 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  40.77 
 
 
272 aa  162  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.92 
 
 
265 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  40.93 
 
 
291 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  39.92 
 
 
285 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  35 
 
 
266 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2477  hypothetical protein  44.09 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  40.73 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3198  ABC-3 protein  39.93 
 
 
319 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0525861 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.36 
 
 
263 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0605  cation ABC transporter, permease protein, putative  41.5 
 
 
269 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0757  ABC-3 protein  41.5 
 
 
269 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.422432  normal  0.510372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2476  hypothetical protein  42.91 
 
 
303 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1609  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  35.34 
 
 
263 aa  129  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2088  ABC-3 protein  45.2 
 
 
278 aa  125  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  37.45 
 
 
298 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2615  ABC-3 protein  38.98 
 
 
291 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2366  ABC-3 protein  45.87 
 
 
257 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0984  ABC-3 protein  38.22 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  37.92 
 
 
294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0218  ABC-3 protein  34.62 
 
 
265 aa  119  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000173393  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0604  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.33 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0756  ABC-3 protein  36.72 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.929566  normal  0.294702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2374  ABC-3 protein  38.94 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0294  ABC-3 protein  38.04 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2639  ABC-3 protein  38.5 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.668793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
274 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  29.12 
 
 
264 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2089  ABC-3 protein  38.28 
 
 
287 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  30.25 
 
 
269 aa  103  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.99 
 
 
280 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  33.76 
 
 
304 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35280  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  38.6 
 
 
298 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.74517  normal  0.501768 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  26.47 
 
 
275 aa  99.4  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  27.86 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  27.73 
 
 
284 aa  99  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  26.07 
 
 
278 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  27.88 
 
 
274 aa  98.6  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  26.07 
 
 
278 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.98 
 
 
282 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  34.63 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.77 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0354  ABC-3 protein  35.98 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.98 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.98 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.98 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  28.51 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  27.35 
 
 
274 aa  95.9  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  31.54 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  30.04 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  28.77 
 
 
288 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  28.77 
 
 
288 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  28.77 
 
 
288 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  28.99 
 
 
264 aa  95.5  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  31.42 
 
 
278 aa  95.1  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  28.2 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  29.06 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  30.8 
 
 
294 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  29.06 
 
 
272 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  28.9 
 
 
288 aa  92.8  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  31.09 
 
 
275 aa  92.4  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  32.05 
 
 
277 aa  92.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  27.43 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  30.51 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  27.86 
 
 
276 aa  92  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.82 
 
 
330 aa  92  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  27.24 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  29.46 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  28.2 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  29.01 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  28.63 
 
 
277 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  30.74 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  33.33 
 
 
287 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  28.94 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>