More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2626 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  100 
 
 		 260 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  99.23 
 
 		 260 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  99.23 
 
 		 260 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  97.69 
 
 		 260 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  97.31 
 
 		 260 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  96.14 
 
 		 262 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  96.15 
 
 		 260 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  86.92 
 
 		 263 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  87.31 
 
 		 274 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  87.31 
 
 		 263 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  87.31 
 
 		 274 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  87.31 
 
 		 274 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  87.31 
 
 		 274 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  87.31 
 
 		 274 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  87.31 
 
 		 274 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  83.08 
 
 		 260 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  83.08 
 
 		 260 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  83.46 
 
 		 263 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  59.16 
 
 		 264 aa  285  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  43.46 
 
 		 293 aa  205  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  46.18 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  46.4 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  41.13 
 
 		 285 aa  168  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  41.31 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  40.89 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  40.89 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  40.89 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  36.58 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.47 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  39.46 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  38.04 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2477  hypothetical protein  43.02 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.5 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  39.17 
 
 		 298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2615  ABC-3 protein  40.94 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3198  ABC-3 protein  39.03 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0525861 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0757  ABC-3 protein  40.71 
 
 		 269 aa  131  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.422432  normal  0.510372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0605  cation ABC transporter, permease protein, putative  40.71 
 
 		 269 aa  131  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1609  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  35.21 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  40.26 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0984  ABC-3 protein  39 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0218  ABC-3 protein  35.41 
 
 		 265 aa  123  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000173393  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2374  ABC-3 protein  39.38 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2476  hypothetical protein  41.41 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2088  ABC-3 protein  43.6 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0294  ABC-3 protein  38.26 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2639  ABC-3 protein  40.53 
 
 		 295 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.668793  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2366  ABC-3 protein  47.26 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0756  ABC-3 protein  35.57 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.929566  normal  0.294702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0604  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.57 
 
 		 296 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  29.89 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35280  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  39.36 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.74517  normal  0.501768 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.83 
 
 		 280 aa  111  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  36.26 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2089  ABC-3 protein  37.59 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  32.78 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0354  ABC-3 protein  37.99 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  31.09 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  30 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  26.87 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  30.89 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 304 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.2 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  28.27 
 
 		 277 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  31.95 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  30.42 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  30.49 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  28.87 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  32.58 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  29.59 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  31.34 
 
 		 272 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  29.52 
 
 		 276 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.12 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.48 
 
 		 282 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  28.96 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  26.85 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.22 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  26.85 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  30.54 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  29.22 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  33.47 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.12 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  31.93 
 
 		 275 aa  97.1  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.22 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.12 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  28.89 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.12 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  32.58 
 
 		 269 aa  95.9  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  28.95 
 
 		 285 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  28.63 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  32.63 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  29.1 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  29.39 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  28.11 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  29.32 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  28.11 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>