More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2089 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2089  ABC-3 protein  100 
 
 
287 aa  536  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2476  hypothetical protein  48.26 
 
 
303 aa  189  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3198  ABC-3 protein  47.06 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0525861 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  35.84 
 
 
293 aa  152  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  37.88 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  37.88 
 
 
288 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  37.88 
 
 
288 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  38.28 
 
 
263 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  34.72 
 
 
291 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  37.59 
 
 
260 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  37.22 
 
 
260 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  37.22 
 
 
260 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  34.92 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  37.59 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  37.04 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  37.59 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  36.84 
 
 
262 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  37.59 
 
 
263 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  37.59 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  38.06 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  31.62 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  35.97 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  36.29 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  36.06 
 
 
260 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  32.97 
 
 
298 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0604  cation ABC transporter, permease protein, putative  34.14 
 
 
296 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0756  ABC-3 protein  34.14 
 
 
301 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.929566  normal  0.294702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2088  ABC-3 protein  37.05 
 
 
278 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  34.19 
 
 
272 aa  95.5  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  28.86 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  28.86 
 
 
288 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  28.86 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  35.14 
 
 
263 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  28.86 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0984  ABC-3 protein  34.17 
 
 
289 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2615  ABC-3 protein  35.05 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  32.6 
 
 
277 aa  93.6  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  28.46 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  27.44 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  35.14 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2477  hypothetical protein  38.37 
 
 
308 aa  89  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0294  ABC-3 protein  33.61 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  28.14 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  26.79 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  35.14 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  30.1 
 
 
279 aa  87  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  30.32 
 
 
282 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  26.79 
 
 
300 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  30.4 
 
 
304 aa  85.9  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  27.13 
 
 
266 aa  86.3  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  30 
 
 
276 aa  85.5  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  28.97 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  28.97 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  32.13 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  25.64 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  28.38 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  28.02 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  30.62 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  27.87 
 
 
284 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  31.95 
 
 
262 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  27.21 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1609  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.08 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2639  ABC-3 protein  34.72 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.668793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  30.52 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  30.08 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  30.52 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  30.68 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  23.19 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  25.7 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  25.7 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  28.04 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  26.92 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2374  ABC-3 protein  32.86 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  33.21 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0354  ABC-3 protein  36.79 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  27.01 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  28.32 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  29.63 
 
 
285 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  24.9 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0237  ABC-3 protein  36.08 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00468194 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  27.24 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  27.82 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35280  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.64 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.74517  normal  0.501768 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  24.18 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  24.18 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  30.67 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  26.57 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  29.63 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  31.02 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  24.73 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  30.38 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  31.56 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  26.98 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  31.03 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>