More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0757 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0605  cation ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 269 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0757  ABC-3 protein  100 
 
 		 269 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.422432  normal  0.510372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  53.79 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2366  ABC-3 protein  49.8 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  40.84 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  36.43 
 
 		 293 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  41.5 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  41.11 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  41.11 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  40.53 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  40.6 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  40.71 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  39.02 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  40.32 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  40.32 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  40 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  37.45 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  34.84 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  35.8 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  34.72 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  34.72 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  34.72 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  38.64 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 291 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.38 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  39.13 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  37.5 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  29.17 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  31.4 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  35.21 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0218  ABC-3 protein  32.95 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000173393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2615  ABC-3 protein  33.73 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.91 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.73 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0294  ABC-3 protein  36.07 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0756  ABC-3 protein  35.22 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.929566  normal  0.294702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2477  hypothetical protein  33.85 
 
 		 308 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0604  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.22 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35280  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.27 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.74517  normal  0.501768 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  27.62 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1609  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.22 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  32.68 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0984  ABC-3 protein  34.09 
 
 		 289 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  29.37 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  28.25 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  31.23 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3198  ABC-3 protein  33.81 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0525861 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  28.15 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  34.4 
 
 		 280 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  26.64 
 
 		 268 aa  85.9  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  26.89 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  30.51 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0354  ABC-3 protein  33.91 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2374  ABC-3 protein  33.89 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  31.69 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  31 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  30.83 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  35.06 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  30.16 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  30.56 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  27.75 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  30.16 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  30.16 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  30.16 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  27.83 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  28.44 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  27.75 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  30.16 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0125  ABC-3 transporter protein, membrane component  30.19 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.291057  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  26.61 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  26.25 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  26.81 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  25.52 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  25.21 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  32.56 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  27.38 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  28.4 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  31.47 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  31.67 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  31.03 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  28.03 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  30.6 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  27.94 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  28.44 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  26.36 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0056  ABC-3 protein  28.2 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0649375  normal  0.0936265 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  26.61 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  29.11 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  31.65 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>