More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1456 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  100 
 
 
291 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  86.62 
 
 
285 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  74.65 
 
 
288 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  74.65 
 
 
288 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  74.3 
 
 
288 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  57.14 
 
 
277 aa  278  9e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  49.01 
 
 
293 aa  202  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  42.15 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  40.93 
 
 
263 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  40.93 
 
 
263 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  40.93 
 
 
274 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  40.93 
 
 
274 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  40.93 
 
 
274 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  40.93 
 
 
274 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  40.93 
 
 
274 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  40.93 
 
 
274 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  41.31 
 
 
260 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  41.31 
 
 
260 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  40.93 
 
 
260 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  40.93 
 
 
260 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  40.93 
 
 
260 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  40.54 
 
 
260 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  41.3 
 
 
262 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.5 
 
 
265 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  39.78 
 
 
298 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  39.68 
 
 
304 aa  148  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  41.7 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  41.31 
 
 
260 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  40.46 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  39.62 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2476  hypothetical protein  41.43 
 
 
303 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3198  ABC-3 protein  40.64 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0525861 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.75 
 
 
263 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2477  hypothetical protein  43.53 
 
 
308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1609  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  32.81 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  36.5 
 
 
272 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2639  ABC-3 protein  36.82 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.668793  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2374  ABC-3 protein  34.66 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0984  ABC-3 protein  39.33 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  29.96 
 
 
266 aa  119  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  35.71 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2089  ABC-3 protein  34.72 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0605  cation ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
269 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0237  ABC-3 protein  38.4 
 
 
297 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00468194 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0757  ABC-3 protein  33.33 
 
 
269 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.422432  normal  0.510372 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  32.62 
 
 
280 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2615  ABC-3 protein  37.39 
 
 
291 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2088  ABC-3 protein  36.63 
 
 
278 aa  106  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35280  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.02 
 
 
298 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.74517  normal  0.501768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0354  ABC-3 protein  35 
 
 
278 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  33.82 
 
 
270 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  32.3 
 
 
289 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2366  ABC-3 protein  36.44 
 
 
257 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  32.31 
 
 
277 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  30.95 
 
 
264 aa  100  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0218  ABC-3 protein  33.6 
 
 
265 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000173393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  32.69 
 
 
287 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  28.62 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  29.96 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  34.82 
 
 
304 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  32.97 
 
 
277 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  30.74 
 
 
279 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  28.74 
 
 
284 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  28.14 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  30.42 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30.36 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.54 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  28.46 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  29.81 
 
 
281 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  25.86 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  25.86 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.17 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  26.97 
 
 
268 aa  92.4  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  27.87 
 
 
288 aa  92.4  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  27.87 
 
 
288 aa  92.4  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  27.87 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.17 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  29.7 
 
 
274 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.17 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.17 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  27.87 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 
269 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  27.54 
 
 
269 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  30 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  29.01 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  29.5 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  29.01 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0756  ABC-3 protein  32.44 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.929566  normal  0.294702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0604  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.44 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0294  ABC-3 protein  34.07 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.3 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  25.64 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  25.64 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  25.64 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4436  hypothetical protein  31.44 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44647  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  26.01 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  25.64 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  25.64 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  25.64 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>