More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0237 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0237  ABC-3 protein  100 
 
 		 297 aa  552  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  72.04 
 
 		 298 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2374  ABC-3 protein  68.52 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2639  ABC-3 protein  67.83 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.668793  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  54.03 
 
 		 294 aa  242  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0984  ABC-3 protein  56.6 
 
 		 289 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35280  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  55.74 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.74517  normal  0.501768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0354  ABC-3 protein  53.48 
 
 		 278 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  38.13 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  39.93 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  39.93 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  39.93 
 
 		 288 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  43.03 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  37.69 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  36.54 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  38.93 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  38.93 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  38.93 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  38.93 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  38.93 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  38.93 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  38.93 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  38.93 
 
 		 263 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  38.52 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  40.82 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  38.93 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  38.93 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  32.61 
 
 		 277 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  40.82 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  41.22 
 
 		 260 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  39.22 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.95 
 
 		 265 aa  126  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2615  ABC-3 protein  37.02 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.16 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0756  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 301 aa  112  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.929566  normal  0.294702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0604  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.36 
 
 		 296 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  30.77 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  38.93 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  33.99 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.48 
 
 		 263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  38.11 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  33.98 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  32.82 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.13 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  31.62 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  36.47 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2477  hypothetical protein  36.2 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  29.55 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1609  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.08 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  29.96 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  29.55 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  29.55 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  29.55 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  29.55 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  29.96 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  36.24 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  31.78 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  22.91 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  22.91 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  31.44 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2476  hypothetical protein  37.61 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  26.44 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0294  ABC-3 protein  36.6 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  26.1 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  30.51 
 
 		 289 aa  95.9  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0757  ABC-3 protein  36.05 
 
 		 269 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.422432  normal  0.510372 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0605  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.05 
 
 		 269 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  31.69 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2089  ABC-3 protein  35.23 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  24.64 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  27.66 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2088  ABC-3 protein  38.61 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  25.35 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  25.35 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  25.35 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  30.5 
 
 		 272 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  30.5 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  25.35 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  26.98 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  30.16 
 
 		 271 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3613  hypothetical protein  30.49 
 
 		 270 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00635836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3198  ABC-3 protein  33.79 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0525861 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  25.31 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  33.33 
 
 		 275 aa  89.7  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  26.84 
 
 		 281 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  30.83 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  36 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  29.71 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  29.86 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  34.39 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0218  ABC-3 protein  28.4 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000173393  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  32.77 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  25.46 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>