More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0756 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0756  ABC-3 protein  100 
 
 		 301 aa  579  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.929566  normal  0.294702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0604  cation ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 296 aa  567  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0294  ABC-3 protein  64.04 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2367  ABC-3 protein  55.69 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.943985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2615  ABC-3 protein  42.69 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.72 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.08 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  35.08 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  36.61 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  35.97 
 
 		 260 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  35.97 
 
 		 260 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  35.18 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  35.57 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  32.55 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  37.3 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  35.18 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  36.72 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  36.72 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  36.72 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  36.26 
 
 		 270 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  34.77 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  33.86 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  31.47 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  30.42 
 
 		 264 aa  99.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  33.06 
 
 		 260 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  33.06 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.46 
 
 		 265 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  31.22 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  32.7 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0984  ABC-3 protein  32.51 
 
 		 289 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.96 
 
 		 270 aa  92.8  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  27.57 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2639  ABC-3 protein  32.06 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.668793  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  29.29 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2374  ABC-3 protein  32.1 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192422 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  27.9 
 
 		 280 aa  89.4  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0757  ABC-3 protein  34.89 
 
 		 269 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.422432  normal  0.510372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0605  cation ABC transporter, permease protein, putative  34.89 
 
 		 269 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  31.6 
 
 		 269 aa  89  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  32.06 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.23 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2089  ABC-3 protein  34.14 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  29.34 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.34 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0237  ABC-3 protein  35.55 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468194 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  26.69 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  26.69 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  26.69 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  26.69 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  26.69 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  26.69 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0354  ABC-3 protein  32.51 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  27.04 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35280  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.85 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.74517  normal  0.501768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  31.32 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  26.77 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  26.77 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  27.39 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2088  ABC-3 protein  34.6 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3198  ABC-3 protein  32.91 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0525861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  29.22 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  29.22 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  25.5 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  29.22 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  29.22 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  29.6 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2476  hypothetical protein  31.09 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  25.97 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  29.6 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  29.6 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  29.6 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  29.6 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  29.6 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  29.6 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  30.04 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  28.81 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  29.06 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  29.01 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  30.33 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  30.33 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  25.99 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  23.48 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.45 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  32.2 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  27.47 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1609  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  25.94 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>