More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0295 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  100 
 
 		 270 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0757  ABC-3 protein  53.79 
 
 		 269 aa  228  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.422432  normal  0.510372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0605  cation ABC transporter, permease protein, putative  53.79 
 
 		 269 aa  228  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2366  ABC-3 protein  58.82 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  48.03 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  46 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  46 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  46 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  46 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  46 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  46 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  46 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  45.2 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  47.2 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  46.8 
 
 		 262 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  46 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  46.4 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  40 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  45.6 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  45.6 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  45.2 
 
 		 260 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  42.8 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  44.4 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  44.4 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  38.81 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  38.81 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  38.43 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  42.31 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  38.49 
 
 		 291 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  39.23 
 
 		 285 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.14 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  37.19 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.68 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0604  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.26 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0756  ABC-3 protein  36.26 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.929566  normal  0.294702 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  31.92 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0294  ABC-3 protein  38.82 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  29.29 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.78 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1609  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.65 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  36.02 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  24.43 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  24.32 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  26.57 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  26.57 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0984  ABC-3 protein  36.44 
 
 		 289 aa  99.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  29.34 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2615  ABC-3 protein  34.01 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  29.31 
 
 		 289 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0218  ABC-3 protein  28.91 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000173393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  34.85 
 
 		 287 aa  95.5  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  30.17 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  29.75 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  29.75 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  29.75 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  29.75 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  28.03 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  29.34 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  29.34 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2477  hypothetical protein  33.72 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  29.34 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2088  ABC-3 protein  38.78 
 
 		 278 aa  89.7  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  31.49 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  31.49 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  29.18 
 
 		 301 aa  89  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  25.1 
 
 		 268 aa  89  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  31.49 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  31.06 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  31.06 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  31.06 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  31.06 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  31.06 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  25.81 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  31.06 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  31.74 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  22.85 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  22.85 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  24.68 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  31.03 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  30.21 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  31.76 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  29.31 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  28.91 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3198  ABC-3 protein  32.85 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0525861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  30.21 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  30.21 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  30.21 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  30.21 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  28.31 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  25.23 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  25 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  28.62 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  33.91 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  23.26 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  29.58 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  26.36 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  32.58 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  32.13 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>