More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2366 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2366  ABC-3 protein  100 
 
 
257 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  58.82 
 
 
270 aa  224  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0605  cation ABC transporter, permease protein, putative  49.8 
 
 
269 aa  185  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0757  ABC-3 protein  49.8 
 
 
269 aa  185  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.422432  normal  0.510372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  42.23 
 
 
272 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  45.68 
 
 
263 aa  148  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  46.28 
 
 
263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  46.09 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  46.09 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  46.09 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  46.09 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  46.09 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  46.09 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  44.09 
 
 
264 aa  141  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  48.36 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  47.54 
 
 
262 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  47.11 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  47.13 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  46.75 
 
 
260 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  46.28 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  46.28 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  39.26 
 
 
293 aa  129  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  45.87 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  45 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  45.87 
 
 
260 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  37.92 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  39.67 
 
 
288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  39.67 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  39.67 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  36.61 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  36.44 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  36.41 
 
 
277 aa  105  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.8 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.57 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  26.88 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2088  ABC-3 protein  40.08 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  25.63 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  24.89 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  32.37 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2615  ABC-3 protein  34.66 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  24.27 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  24.27 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2477  hypothetical protein  33.07 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.77 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  26.9 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  22.27 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  31.18 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  32.52 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  25.24 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  29.65 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  25.23 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0604  cation ABC transporter, permease protein, putative  31.4 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  27.73 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0756  ABC-3 protein  31.4 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.929566  normal  0.294702 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  28.93 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  31.91 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  28.51 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07780  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.17 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  26.75 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  28.8 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  22.32 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  25.4 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  31.75 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1609  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.47 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  22.6 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  22.75 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  22.6 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  22.6 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  32.91 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.66 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35280  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  37.73 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.74517  normal  0.501768 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.66 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.66 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.66 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  27.66 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  27.94 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  29.71 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  32.64 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  24.79 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4004  hypothetical protein  28.91 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2187  ABC transporter membrane spanning protein (zinc)  30 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  26.05 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  24.31 
 
 
279 aa  62.8  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  30.14 
 
 
281 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  26.47 
 
 
269 aa  62.4  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  31 
 
 
294 aa  62.4  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  28.43 
 
 
280 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0294  ABC-3 protein  31.95 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  26.98 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6286  ABC-3 protein  35 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  26.9 
 
 
277 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  26.98 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  23.95 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  27.94 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  21.84 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4436  hypothetical protein  28.49 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44647  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  27.94 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  27.85 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>