278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0318 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0318  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  100 
 
 
181 aa  363  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  94.48 
 
 
738 aa  358  3e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  61.33 
 
 
727 aa  246  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  59.12 
 
 
734 aa  233  9e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  59.12 
 
 
734 aa  233  9e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  59.12 
 
 
739 aa  206  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  46.96 
 
 
727 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  45.51 
 
 
716 aa  167  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  43.09 
 
 
747 aa  160  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  37.99 
 
 
721 aa  155  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  42.05 
 
 
760 aa  154  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  39.23 
 
 
715 aa  141  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  35.75 
 
 
759 aa  138  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  36.67 
 
 
738 aa  135  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  36.31 
 
 
1038 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  34.64 
 
 
1011 aa  134  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  36.31 
 
 
1038 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  34.64 
 
 
1013 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  40.49 
 
 
717 aa  132  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  37.02 
 
 
906 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  37.02 
 
 
906 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  38.33 
 
 
722 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  35 
 
 
716 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.2 
 
 
1019 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  34.64 
 
 
908 aa  124  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  36.11 
 
 
721 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.2 
 
 
908 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  31.11 
 
 
699 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  32.22 
 
 
695 aa  108  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  30.98 
 
 
721 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  30.17 
 
 
1042 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  27.37 
 
 
1040 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  28.26 
 
 
723 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  28.26 
 
 
723 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.17 
 
 
1018 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  25 
 
 
726 aa  94.4  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  29.61 
 
 
1018 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.21 
 
 
1024 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  26.82 
 
 
999 aa  91.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  28.18 
 
 
722 aa  91.7  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  27.07 
 
 
722 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  27.72 
 
 
724 aa  90.1  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.05 
 
 
1018 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  30.22 
 
 
772 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.22 
 
 
753 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  30.22 
 
 
753 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.67 
 
 
770 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  30.22 
 
 
753 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  30.22 
 
 
753 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  30.22 
 
 
753 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  29.12 
 
 
712 aa  89.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  28.57 
 
 
725 aa  88.6  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  30.22 
 
 
753 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  27.37 
 
 
743 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  28.88 
 
 
733 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  26.52 
 
 
736 aa  85.9  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.4 
 
 
1008 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.4 
 
 
1008 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  26.92 
 
 
726 aa  84.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  27.81 
 
 
725 aa  84.3  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  29.61 
 
 
738 aa  84.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  20.67 
 
 
724 aa  82.4  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  20.67 
 
 
724 aa  82.4  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  28.02 
 
 
696 aa  81.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  29.67 
 
 
707 aa  81.3  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  29.67 
 
 
707 aa  81.3  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0021  sublancin 168 processing and transport ATP-binding protein  31.15 
 
 
701 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  29.12 
 
 
704 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  29.45 
 
 
726 aa  78.2  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  23.08 
 
 
719 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  28.18 
 
 
716 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  25 
 
 
720 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  25 
 
 
720 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  24.02 
 
 
731 aa  77  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  25 
 
 
918 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  28.02 
 
 
739 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25 
 
 
1013 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 
1000 aa  75.5  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  27.21 
 
 
750 aa  74.7  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  24.67 
 
 
743 aa  74.7  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  22.65 
 
 
705 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.07 
 
 
1012 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  24.73 
 
 
1001 aa  73.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  23.37 
 
 
711 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  29.32 
 
 
728 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  26.02 
 
 
712 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  23.08 
 
 
719 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  23.78 
 
 
741 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  21.23 
 
 
731 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  23.78 
 
 
739 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  25.41 
 
 
714 aa  72  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  22.84 
 
 
728 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  27.03 
 
 
986 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  30.1 
 
 
741 aa  71.6  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  25.16 
 
 
728 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  28.18 
 
 
727 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  23.08 
 
 
715 aa  70.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  24.06 
 
 
1003 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  26.4 
 
 
727 aa  70.5  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  26.23 
 
 
930 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>