203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2603 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2603  putative resolvase  100 
 
 		 589 aa  1182    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00221459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.08 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4608  DNA recombinase, putative  25.9 
 
 		 511 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  30.22 
 
 		 524 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4587  DNA recombinase, putative  26.09 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  44.12 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0849  DNA recombinase, putative  27.23 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0853  DNA recombinase, putative  27.23 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000111674 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  28.74 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  27.95 
 
 		 532 aa  67  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  28.34 
 
 		 546 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  28.82 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.94 
 
 		 546 aa  63.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  28.83 
 
 		 521 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  30 
 
 		 613 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  26.18 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.21 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  29.81 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  26.99 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  26.15 
 
 		 542 aa  58.9  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  26.15 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  26.51 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  30.69 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  26.51 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  27.94 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.89 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  24.76 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  30.77 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  30.46 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  30.46 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  29.45 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0854  DNA recombinase, putative  29.34 
 
 		 543 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000136603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0850  DNA recombinase, putative  29.34 
 
 		 543 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  32.39 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  30.46 
 
 		 192 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  27.43 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  27.52 
 
 		 295 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  28.31 
 
 		 665 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  39.6 
 
 		 537 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  29.6 
 
 		 475 aa  56.2  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  24.08 
 
 		 281 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.61 
 
 		 485 aa  55.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  27.5 
 
 		 489 aa  54.3  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  27.71 
 
 		 568 aa  54.3  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  27.44 
 
 		 526 aa  53.9  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  28.29 
 
 		 500 aa  53.9  0.000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 		 540 aa  53.5  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 515 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.38 
 
 		 542 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.21 
 
 		 558 aa  52.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  26.71 
 
 		 449 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  25.12 
 
 		 542 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  27.33 
 
 		 511 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  26.71 
 
 		 449 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.38 
 
 		 542 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.38 
 
 		 542 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  26.22 
 
 		 449 aa  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  24.74 
 
 		 546 aa  52  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  27.67 
 
 		 185 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  27.67 
 
 		 185 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  27.67 
 
 		 185 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  27.67 
 
 		 185 aa  52  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  27.63 
 
 		 186 aa  51.6  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  27.67 
 
 		 185 aa  51.6  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  28.1 
 
 		 185 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  27.61 
 
 		 188 aa  51.2  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  28.14 
 
 		 441 aa  51.2  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  30.86 
 
 		 534 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0254  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 		 211 aa  51.2  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0277  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 		 211 aa  51.2  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0887  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 		 211 aa  51.2  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  28.22 
 
 		 498 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0073  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 		 211 aa  51.2  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  30.43 
 
 		 187 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  26.95 
 
 		 443 aa  50.8  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  25.6 
 
 		 476 aa  50.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  27.34 
 
 		 230 aa  50.4  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  26.17 
 
 		 527 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  26.67 
 
 		 641 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  29.71 
 
 		 534 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  31.1 
 
 		 547 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  28.09 
 
 		 188 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  31.9 
 
 		 580 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.96 
 
 		 517 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  27.62 
 
 		 184 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  28.67 
 
 		 199 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  20.77 
 
 		 549 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  25.13 
 
 		 522 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  24.68 
 
 		 188 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  27.04 
 
 		 186 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  28.82 
 
 		 534 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  28.29 
 
 		 186 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  28.82 
 
 		 534 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  29.26 
 
 		 549 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.15 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 		 188 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  27.07 
 
 		 197 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  27.01 
 
 		 185 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  28.67 
 
 		 199 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  27.22 
 
 		 186 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>