More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1411 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1411  M24/M37 family peptidase  100 
 
 		 397 aa  788    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1291  M24/M37 family peptidase  98.49 
 
 		 397 aa  775    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0497924  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0450  M24/M37 family peptidase  97.48 
 
 		 397 aa  742    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.226008  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0614  peptidase, M23/M37 family  60.31 
 
 		 391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1215  M24/M37 family peptidase  55.61 
 
 		 388 aa  401  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0480  M24/M37 family peptidase  52.33 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0503  transaldolase  48.78 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0644  Peptidase M23  41.23 
 
 		 408 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1284  M24/M37 family peptidase  40.89 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.276116  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0788  peptidase M23B  30.68 
 
 		 408 aa  209  5e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  21.86 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  23.1 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  29.17 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  30.43 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  23.5 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  30.09 
 
 		 605 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  27.74 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  25.55 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  22.73 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  26.92 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  23.65 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  19.51 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  32.67 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  32.33 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  30.08 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  25.91 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  33.66 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  25 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  31.86 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  22.66 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  24.81 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  31.86 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  31.86 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  29.63 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  32.74 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  28.37 
 
 		 295 aa  57  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  31.58 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  28.03 
 
 		 282 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  23.56 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  24.81 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  23.56 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  26.67 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2479  Peptidase M23  38.81 
 
 		 237 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  22.43 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  23.56 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  30.77 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  28.1 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  30.69 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  31.4 
 
 		 437 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  30.16 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  24.07 
 
 		 414 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  21.55 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  32.1 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  25 
 
 		 465 aa  53.9  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  26.23 
 
 		 446 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  27.64 
 
 		 503 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  24.81 
 
 		 457 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  27.73 
 
 		 319 aa  53.9  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  24.81 
 
 		 457 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  26.42 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  32.14 
 
 		 225 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  33.94 
 
 		 306 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  25.98 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  30.88 
 
 		 269 aa  53.5  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  24.18 
 
 		 376 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  28.32 
 
 		 446 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  22.33 
 
 		 375 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  30.69 
 
 		 455 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  27.05 
 
 		 305 aa  53.1  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  28.97 
 
 		 295 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  25.2 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  25 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  26.83 
 
 		 473 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  24.81 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  30.28 
 
 		 541 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  31.68 
 
 		 460 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  30.77 
 
 		 602 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  33.33 
 
 		 293 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  26.67 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  21.46 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  26.83 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  26.83 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  25.55 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  29.13 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  26.83 
 
 		 319 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  28.32 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  25.55 
 
 		 610 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  31.33 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  29.55 
 
 		 509 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  25.86 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  26.83 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  26.83 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  26.83 
 
 		 318 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  24.21 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  25.37 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  23.44 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  23.97 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  26.02 
 
 		 475 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  30.69 
 
 		 457 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  31.33 
 
 		 275 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>