271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0480 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0480  M24/M37 family peptidase  100 
 
 
408 aa  818    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0503  transaldolase  76.35 
 
 
405 aa  622  1e-177  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1215  M24/M37 family peptidase  58.23 
 
 
388 aa  451  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1291  M24/M37 family peptidase  53.65 
 
 
397 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0497924  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1411  M24/M37 family peptidase  53.39 
 
 
397 aa  375  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0450  M24/M37 family peptidase  52.86 
 
 
397 aa  375  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.226008  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0614  peptidase, M23/M37 family  48.89 
 
 
391 aa  355  8.999999999999999e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0644  Peptidase M23  44.94 
 
 
408 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1284  M24/M37 family peptidase  43.02 
 
 
435 aa  317  3e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.276116  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0788  peptidase M23B  35.29 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  25.06 
 
 
379 aa  67  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  27.74 
 
 
375 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  19.68 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  23.92 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  21.77 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  32 
 
 
423 aa  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  29.55 
 
 
450 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  23 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  24.78 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  29.32 
 
 
345 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  23.86 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  32 
 
 
439 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  30.23 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  31.2 
 
 
440 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  28.46 
 
 
404 aa  60.5  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  28.57 
 
 
457 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  18.47 
 
 
391 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  29 
 
 
394 aa  59.7  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  24.46 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  26.52 
 
 
430 aa  58.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  28.19 
 
 
412 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  28.57 
 
 
457 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  28.57 
 
 
457 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  23.42 
 
 
404 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  30 
 
 
449 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  36.08 
 
 
387 aa  57.4  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  31.58 
 
 
295 aa  57  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  22.65 
 
 
397 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  25.2 
 
 
400 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  27.82 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2548  Peptidase M23  31.01 
 
 
285 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000368536  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  26.64 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  33.33 
 
 
484 aa  56.2  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  25.1 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  33.6 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  24.44 
 
 
428 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  29.37 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  23 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  28.22 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  32.28 
 
 
249 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  30.71 
 
 
373 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  30.71 
 
 
372 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  33.33 
 
 
437 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  21.57 
 
 
411 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  28.68 
 
 
328 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2479  Peptidase M23  53.49 
 
 
237 aa  53.5  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  32.8 
 
 
420 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  27.07 
 
 
454 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  26.17 
 
 
375 aa  53.1  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  27.34 
 
 
301 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  29.7 
 
 
457 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  32.29 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.63 
 
 
454 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  25.71 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  26.91 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  33.08 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  33.71 
 
 
436 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  32.8 
 
 
400 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  28.97 
 
 
503 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  24.36 
 
 
456 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  23.1 
 
 
433 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  28.28 
 
 
480 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  28.15 
 
 
450 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  24.36 
 
 
456 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  32.8 
 
 
421 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  22.12 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  32.8 
 
 
421 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  24.36 
 
 
456 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  29.13 
 
 
312 aa  51.2  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  31.48 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  32.32 
 
 
438 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  29.69 
 
 
300 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  32.29 
 
 
392 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  27.08 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  28.57 
 
 
313 aa  50.8  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  28.37 
 
 
464 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  25.55 
 
 
247 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  23.11 
 
 
438 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  26.56 
 
 
453 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  21.39 
 
 
374 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  25.11 
 
 
375 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  31.62 
 
 
288 aa  50.4  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  26.92 
 
 
610 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  23.04 
 
 
438 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  24.36 
 
 
321 aa  50.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  27.73 
 
 
605 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  25.78 
 
 
300 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  32.61 
 
 
434 aa  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  29.89 
 
 
448 aa  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  25.98 
 
 
399 aa  50.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>