145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2479 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2479  Peptidase M23  100 
 
 
237 aa  477  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3014  Peptidase M23  60.5 
 
 
238 aa  275  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0156  Peptidase M23  35.98 
 
 
311 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000212868  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1284  M24/M37 family peptidase  50 
 
 
435 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.276116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1291  M24/M37 family peptidase  38.81 
 
 
397 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0497924  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1411  M24/M37 family peptidase  38.81 
 
 
397 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0450  M24/M37 family peptidase  38.81 
 
 
397 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.226008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  30.61 
 
 
676 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  42.86 
 
 
345 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  43.28 
 
 
577 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0480  M24/M37 family peptidase  53.49 
 
 
408 aa  53.1  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  42.86 
 
 
457 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  43.28 
 
 
577 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  42.86 
 
 
457 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  42.86 
 
 
457 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  50 
 
 
450 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  29.93 
 
 
681 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  32.09 
 
 
697 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0503  transaldolase  55.81 
 
 
405 aa  52.8  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  39.68 
 
 
465 aa  53.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  32.09 
 
 
697 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0644  Peptidase M23  38.36 
 
 
408 aa  52.8  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2787  peptidase M23  39.33 
 
 
317 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  48.89 
 
 
448 aa  52.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  31.34 
 
 
699 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.1 
 
 
441 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1215  M24/M37 family peptidase  48.84 
 
 
388 aa  50.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  39.68 
 
 
454 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  42.03 
 
 
499 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  51.11 
 
 
420 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  51.11 
 
 
490 aa  48.9  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  46.67 
 
 
459 aa  48.9  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  38.1 
 
 
503 aa  48.9  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  40.3 
 
 
581 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  48.89 
 
 
569 aa  48.9  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0614  peptidase, M23/M37 family  48.84 
 
 
391 aa  48.5  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  51.11 
 
 
400 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  46.67 
 
 
438 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  51.11 
 
 
421 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  44.64 
 
 
995 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  51.11 
 
 
425 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  51.11 
 
 
421 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  37.5 
 
 
602 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  51.11 
 
 
425 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  48.89 
 
 
353 aa  48.1  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  48.89 
 
 
621 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  46.67 
 
 
651 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  42.03 
 
 
512 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  42.03 
 
 
472 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  42.03 
 
 
471 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  46.67 
 
 
651 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  35.16 
 
 
389 aa  47  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  51.11 
 
 
412 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0788  peptidase M23B  47.5 
 
 
408 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  42.03 
 
 
470 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  42.03 
 
 
509 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  44.44 
 
 
687 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  44.44 
 
 
651 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2837  Peptidase M23  27.54 
 
 
424 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000204146  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  46.67 
 
 
362 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  46.67 
 
 
477 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  46.67 
 
 
477 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  42.22 
 
 
741 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  46.67 
 
 
457 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  39.68 
 
 
692 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  44.44 
 
 
390 aa  45.8  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  42.22 
 
 
648 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  48.89 
 
 
513 aa  46.2  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  42.22 
 
 
676 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  42.22 
 
 
680 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  46.67 
 
 
645 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  42.86 
 
 
695 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  44.44 
 
 
646 aa  45.8  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  36.51 
 
 
695 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  41.27 
 
 
484 aa  45.4  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  45.83 
 
 
435 aa  45.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  46.67 
 
 
457 aa  45.4  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  39.68 
 
 
690 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  37.68 
 
 
249 aa  45.1  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  44.44 
 
 
523 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  39.44 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  41.3 
 
 
453 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  39.44 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  48.89 
 
 
377 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  33.33 
 
 
681 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  27.33 
 
 
323 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  37 
 
 
293 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  44.44 
 
 
417 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  36.59 
 
 
517 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  46.67 
 
 
490 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  42.22 
 
 
656 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.78 
 
 
312 aa  43.9  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0031  M24/M37 family peptidase  29.09 
 
 
299 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  34.07 
 
 
491 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  39.44 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  33.61 
 
 
413 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  50 
 
 
305 aa  43.9  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1320  hypothetical protein  31.36 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  38.71 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  43.48 
 
 
457 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>