276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1284 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1284  M24/M37 family peptidase  100 
 
 
435 aa  854    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.276116  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0480  M24/M37 family peptidase  43.48 
 
 
408 aa  324  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1215  M24/M37 family peptidase  45.32 
 
 
388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0503  transaldolase  40.28 
 
 
405 aa  300  4e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1411  M24/M37 family peptidase  42.13 
 
 
397 aa  290  4e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1291  M24/M37 family peptidase  42.31 
 
 
397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0497924  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0450  M24/M37 family peptidase  42.07 
 
 
397 aa  286  5.999999999999999e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.226008  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0644  Peptidase M23  37.56 
 
 
408 aa  266  4e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0614  peptidase, M23/M37 family  37.53 
 
 
391 aa  227  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0788  peptidase M23B  32.27 
 
 
408 aa  217  4e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  25.11 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  29.13 
 
 
388 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  28.46 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  25.64 
 
 
375 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  27.27 
 
 
430 aa  63.2  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  25.48 
 
 
394 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  21.69 
 
 
387 aa  63.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  24.64 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  27.74 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  24.17 
 
 
436 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  30.99 
 
 
446 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  23.26 
 
 
398 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  26.36 
 
 
440 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  23.16 
 
 
460 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  27.27 
 
 
469 aa  60.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  27 
 
 
470 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  26.77 
 
 
449 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  25.58 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  27 
 
 
509 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  25.93 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  31.62 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  25.37 
 
 
605 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3014  Peptidase M23  56.52 
 
 
238 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  27.91 
 
 
423 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  26.72 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  20.35 
 
 
434 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  29.58 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  29.58 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  18.71 
 
 
404 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  27 
 
 
472 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  29.23 
 
 
457 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  26.52 
 
 
450 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  26.32 
 
 
345 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  29.37 
 
 
438 aa  57  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  27 
 
 
471 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  27 
 
 
512 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  27.27 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  30.15 
 
 
380 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2479  Peptidase M23  50 
 
 
237 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  26.32 
 
 
457 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  24.07 
 
 
430 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  22.1 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  23.28 
 
 
370 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  24.04 
 
 
456 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  23.04 
 
 
457 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  29.13 
 
 
387 aa  54.3  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  23.04 
 
 
457 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  28.57 
 
 
433 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  25.17 
 
 
379 aa  54.3  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  24.04 
 
 
456 aa  53.9  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  24.59 
 
 
400 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  24.04 
 
 
456 aa  53.9  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  26.4 
 
 
429 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  31.86 
 
 
420 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  30.3 
 
 
456 aa  53.5  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  25.53 
 
 
295 aa  53.5  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  25 
 
 
372 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  25 
 
 
373 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  30.16 
 
 
499 aa  53.5  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  26.14 
 
 
379 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  24.68 
 
 
375 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  30.3 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  26.19 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  32.28 
 
 
602 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  27.55 
 
 
470 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  34.07 
 
 
295 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  30.21 
 
 
382 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  28.18 
 
 
503 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  20.24 
 
 
374 aa  52.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  25.2 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0671  peptidase M23B  25.76 
 
 
431 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0143037  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  24.14 
 
 
372 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  23.03 
 
 
432 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  27.91 
 
 
450 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  31.86 
 
 
421 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  31.86 
 
 
400 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  29.69 
 
 
425 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  31.86 
 
 
421 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  30 
 
 
314 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  24.65 
 
 
610 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  21.99 
 
 
503 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  31.86 
 
 
425 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  23.97 
 
 
397 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2548  Peptidase M23  28.68 
 
 
285 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000368536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  34.57 
 
 
436 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  23.97 
 
 
397 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  28.47 
 
 
247 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  25.4 
 
 
472 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  25.4 
 
 
472 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  26.4 
 
 
440 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>