219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0614 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0614  peptidase, M23/M37 family  100 
 
 		 391 aa  770    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1411  M24/M37 family peptidase  61.21 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0450  M24/M37 family peptidase  60.95 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.226008  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1291  M24/M37 family peptidase  60.69 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0497924  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0503  transaldolase  48.64 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0480  M24/M37 family peptidase  49.38 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1215  M24/M37 family peptidase  50.26 
 
 		 388 aa  360  3e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0644  Peptidase M23  43.46 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1284  M24/M37 family peptidase  41.12 
 
 		 435 aa  276  5e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.276116  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0788  peptidase M23B  34.49 
 
 		 408 aa  223  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  23.37 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  28.34 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  21.21 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  23.83 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  27.21 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  28.99 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  32.54 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  30.6 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  28.57 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  23.27 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  23.13 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  23.88 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  23.13 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  31.71 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  32.52 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  24.6 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  24.25 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  28.87 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  23.95 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  33.83 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  31.71 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  31.71 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  31.71 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  23.9 
 
 		 441 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  25.75 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  21.85 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  32.03 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  21.48 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  30.7 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  26.62 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  27.34 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  26.63 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  31.58 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  33.08 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  33.33 
 
 		 605 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  24.41 
 
 		 453 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  22.93 
 
 		 434 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  24.45 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  24.64 
 
 		 373 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  24.64 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  28.46 
 
 		 480 aa  53.5  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  30.09 
 
 		 438 aa  53.1  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  23.64 
 
 		 394 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  24.64 
 
 		 372 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  23.73 
 
 		 400 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  32.74 
 
 		 446 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  26.87 
 
 		 454 aa  52.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  22.69 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  28.68 
 
 		 288 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  30.3 
 
 		 503 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  22.25 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  33.68 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  30.77 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  28.1 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  30.77 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  28.7 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  31.75 
 
 		 499 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  23.15 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  27.97 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  31.3 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  28.3 
 
 		 474 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  31.68 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  27.52 
 
 		 470 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  25.6 
 
 		 429 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  22.95 
 
 		 517 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  34.94 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  24.22 
 
 		 457 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  26.9 
 
 		 503 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  33.33 
 
 		 436 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  27.36 
 
 		 475 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  32.38 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  25.09 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  30.71 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  23.19 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  25.09 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  25.09 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  22.11 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  28.3 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  30.14 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  29.63 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  29.63 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  31.68 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  30.89 
 
 		 319 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  34.09 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  21.03 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  21.21 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  30.87 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2479  Peptidase M23  48.84 
 
 		 237 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  25.17 
 
 		 274 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  27.91 
 
 		 229 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>