More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0644 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0644  Peptidase M23  100 
 
 		 408 aa  812    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0480  M24/M37 family peptidase  44.94 
 
 		 408 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1215  M24/M37 family peptidase  45.13 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0503  transaldolase  41.87 
 
 		 405 aa  309  5e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0614  peptidase, M23/M37 family  42.96 
 
 		 391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0450  M24/M37 family peptidase  41.93 
 
 		 397 aa  303  5.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.226008  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1411  M24/M37 family peptidase  41.67 
 
 		 397 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1291  M24/M37 family peptidase  42.19 
 
 		 397 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0497924  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1284  M24/M37 family peptidase  36.93 
 
 		 435 aa  260  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.276116  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0788  peptidase M23B  34.06 
 
 		 408 aa  236  7e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  26.79 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  31.54 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  24.79 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  26.13 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  35.07 
 
 		 379 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  27.8 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  28.19 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  29.27 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  27.51 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  34 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  33.33 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  27.05 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  24.05 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  30.08 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  21.6 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  27.82 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  33.62 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  26.36 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  30.08 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  29.05 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  32.52 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  30.89 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  32.52 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  32.52 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  32.52 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  30.08 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  30.08 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  32.52 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  30.89 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  29.93 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  30.89 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  33.73 
 
 		 484 aa  59.7  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  30.53 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  27.61 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  27.56 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  21.08 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  32.14 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  33.33 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  27.07 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1947  Peptidase M23  30.23 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.653444  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  31.71 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  30.77 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  26.96 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  28.45 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  24.87 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  30.69 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  31.91 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  22.42 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  34.65 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  27.07 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  22.42 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  27.72 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  27.07 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  23.48 
 
 		 430 aa  57  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  22.22 
 
 		 454 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  32.5 
 
 		 325 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  19.76 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  32.67 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  31 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  31.25 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  28.24 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  27.27 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  32.97 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  26.9 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  25.23 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  33.04 
 
 		 248 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  25.44 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  36.46 
 
 		 323 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  32.97 
 
 		 275 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  32.48 
 
 		 372 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  29.23 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  35.37 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  25.45 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  24.47 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  25.75 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  28.46 
 
 		 480 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  24.47 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  27.45 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  28.57 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  27.6 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  26.9 
 
 		 468 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  31.5 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  35.14 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  32.43 
 
 		 274 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  26.25 
 
 		 269 aa  55.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  29.32 
 
 		 273 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  23.58 
 
 		 398 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  32.88 
 
 		 459 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  27.03 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  33.71 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>