98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0161 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  100 
 
 
221 aa  455  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  79.62 
 
 
219 aa  366  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  61.9 
 
 
213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  50.71 
 
 
235 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  50.23 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  50.75 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  49.52 
 
 
215 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  53.33 
 
 
236 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  50.26 
 
 
235 aa  192  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  48.33 
 
 
229 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  51.89 
 
 
235 aa  192  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  49.74 
 
 
236 aa  191  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  47.85 
 
 
229 aa  191  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  44.84 
 
 
235 aa  191  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  44.84 
 
 
235 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  44.84 
 
 
235 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  50.91 
 
 
229 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  45.74 
 
 
235 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  45.74 
 
 
235 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  45.74 
 
 
235 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  45.74 
 
 
235 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  45.71 
 
 
216 aa  187  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  50.52 
 
 
237 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  47.39 
 
 
235 aa  184  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  46.12 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  55.77 
 
 
220 aa  180  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  45.36 
 
 
242 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  54.25 
 
 
227 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  47.45 
 
 
213 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  47.45 
 
 
253 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  47.45 
 
 
230 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  46.94 
 
 
251 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  48.19 
 
 
237 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  47.92 
 
 
237 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  50.29 
 
 
226 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  52.94 
 
 
227 aa  175  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  50.57 
 
 
228 aa  174  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  42.01 
 
 
241 aa  174  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  47.46 
 
 
219 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  43.18 
 
 
244 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  43.18 
 
 
244 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  41.55 
 
 
230 aa  158  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  40.72 
 
 
200 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  48.51 
 
 
224 aa  141  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  39.78 
 
 
231 aa  141  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  41.83 
 
 
243 aa  138  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  46.98 
 
 
253 aa  131  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  38.04 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  40.56 
 
 
245 aa  129  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  39.1 
 
 
203 aa  95.9  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40.16 
 
 
330 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.37 
 
 
430 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  41.73 
 
 
406 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  32.28 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  34.29 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  34.03 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.83 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.33 
 
 
329 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  28.48 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  31 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  30.18 
 
 
328 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  34.86 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  35.78 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.4 
 
 
202 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  32.1 
 
 
251 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  32.73 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  28.49 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.79 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  26.95 
 
 
206 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  28.49 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  36.54 
 
 
207 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  36.54 
 
 
206 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.56 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  33 
 
 
184 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  33 
 
 
184 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.66 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2807  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.33 
 
 
230 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.667784  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.35 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  35.58 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  31.31 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3777  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.29 
 
 
235 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.21 
 
 
194 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3134  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  30.09 
 
 
209 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0620467  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2572  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  30 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2170  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  35.58 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106515  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  31.68 
 
 
200 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2806  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.38 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4770  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.38 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  31.87 
 
 
171 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2214  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.94 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.405768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2532  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.76 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2257  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.76 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0430695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4260  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.67 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2406  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.63 
 
 
230 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4117  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  32 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2407  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.65 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.27 
 
 
206 aa  42  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.67 
 
 
224 aa  41.6  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>