89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3777 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3777  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2807  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  65.83 
 
 
230 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.667784  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2213  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  65.09 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2406  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  61.57 
 
 
230 aa  272  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2531  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  64.9 
 
 
234 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2256  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  64.42 
 
 
234 aa  262  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.0631375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2806  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  60.11 
 
 
215 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4770  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  62.05 
 
 
213 aa  218  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2257  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  55.61 
 
 
219 aa  218  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0430695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  55.74 
 
 
224 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2214  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  61.9 
 
 
217 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.405768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2532  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  55.1 
 
 
219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1928  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  55.74 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  0.891038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2204  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  55.74 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4260  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  60.36 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2407  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  61.21 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3779  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  56.99 
 
 
199 aa  210  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3516  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  58.1 
 
 
227 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960432  normal  0.864738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  52.54 
 
 
208 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  50.85 
 
 
206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2572  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  52.73 
 
 
206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2170  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  47.32 
 
 
206 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106515  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  50.28 
 
 
206 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3134  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  48.02 
 
 
209 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0620467  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  46.94 
 
 
207 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  50.32 
 
 
207 aa  174  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  51.57 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.1 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  43.98 
 
 
202 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.05 
 
 
222 aa  138  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  45.45 
 
 
206 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  45.45 
 
 
206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.05 
 
 
202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  45.64 
 
 
201 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  44.97 
 
 
201 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1857  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  44 
 
 
201 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308661  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1042  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.9 
 
 
202 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115252  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2198  hypothetical protein  42.94 
 
 
173 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.33 
 
 
201 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103073  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  41.18 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  41.18 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  36.27 
 
 
204 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2641  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  41.32 
 
 
252 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.498867 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4117  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  39.29 
 
 
218 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  45.16 
 
 
199 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.34 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  39.75 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1964  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.14 
 
 
196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491162  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  42.21 
 
 
171 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.6 
 
 
194 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.5 
 
 
206 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  41.83 
 
 
191 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2713  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  41.83 
 
 
191 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1030  hypothetical protein  36.65 
 
 
214 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3780  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.39 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3234  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.93 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2986  hypothetical protein  37.93 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480275  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4810  periplasmic protein-like protein  38.35 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.008475  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.64 
 
 
330 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.88 
 
 
430 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  37.76 
 
 
328 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  29.85 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  38 
 
 
253 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  38.14 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  38 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  38 
 
 
213 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.65 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  36.84 
 
 
346 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  36 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.75 
 
 
329 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  37.23 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  39.58 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  39.47 
 
 
394 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  28.88 
 
 
226 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  33.96 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  31.3 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  33.33 
 
 
406 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  34.29 
 
 
221 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38 
 
 
229 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  31.62 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37 
 
 
229 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  33.33 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  31.31 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  32.98 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  34.26 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  35.82 
 
 
224 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  34.95 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  31.13 
 
 
227 aa  42  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>