82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3516 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3516  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960432  normal  0.864738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3779  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  97.35 
 
 
199 aa  380  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2257  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  72.2 
 
 
219 aa  298  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0430695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2532  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  71.71 
 
 
219 aa  296  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2214  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  78.31 
 
 
217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.405768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  69.89 
 
 
224 aa  275  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1928  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  69.89 
 
 
222 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  0.891038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2204  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  69.89 
 
 
222 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2806  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  63.8 
 
 
215 aa  269  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2807  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  63.03 
 
 
230 aa  268  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.667784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2406  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  60.63 
 
 
230 aa  268  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2407  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  74.85 
 
 
215 aa  268  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4260  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  70.43 
 
 
213 aa  267  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4770  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  70.27 
 
 
213 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2213  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  58.3 
 
 
233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2531  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  64.13 
 
 
234 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2256  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  63.04 
 
 
234 aa  237  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.0631375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3777  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  53.12 
 
 
235 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2170  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  46.45 
 
 
206 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106515  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2572  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  44.71 
 
 
206 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  50.66 
 
 
207 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  49.08 
 
 
208 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  45.61 
 
 
206 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  49.08 
 
 
207 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3134  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  44.94 
 
 
209 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0620467  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  47.85 
 
 
206 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  44.72 
 
 
212 aa  141  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40.44 
 
 
222 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.7 
 
 
202 aa  131  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4117  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  42.25 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2198  hypothetical protein  40.85 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.36 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1857  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.23 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308661  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  40.26 
 
 
206 aa  125  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  41.32 
 
 
199 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  40.26 
 
 
206 aa  124  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.23 
 
 
201 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103073  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  39.15 
 
 
201 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.13 
 
 
206 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1042  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.41 
 
 
202 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115252  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  38.62 
 
 
201 aa  121  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  42.21 
 
 
202 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1030  hypothetical protein  43.06 
 
 
214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  41.72 
 
 
171 aa  111  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  38.96 
 
 
204 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2641  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.85 
 
 
252 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.498867 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.98 
 
 
206 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3780  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.51 
 
 
220 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  33.54 
 
 
200 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  36.73 
 
 
184 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  36.73 
 
 
184 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.05 
 
 
194 aa  98.6  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1964  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.67 
 
 
196 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491162  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.6 
 
 
191 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2713  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.76 
 
 
191 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2986  hypothetical protein  36.94 
 
 
199 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480275  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3234  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.31 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4810  periplasmic protein-like protein  37.12 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.008475  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  32.69 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  35.05 
 
 
346 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  37.89 
 
 
328 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.57 
 
 
329 aa  52  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36 
 
 
330 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.92 
 
 
430 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  33.67 
 
 
253 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  34 
 
 
200 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  27.88 
 
 
394 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  33.67 
 
 
230 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  25.82 
 
 
244 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  33.67 
 
 
213 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  25.82 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  29.63 
 
 
406 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  32.69 
 
 
242 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  32.32 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  34 
 
 
251 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.95 
 
 
241 aa  45.4  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  32.65 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  35.29 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  31.73 
 
 
241 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  32.32 
 
 
214 aa  42  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  31.43 
 
 
243 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>