86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0890 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  98.36 
 
 
244 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  44.78 
 
 
219 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  40.67 
 
 
214 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  42.79 
 
 
229 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  37.55 
 
 
242 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  44.26 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  44.57 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  46.96 
 
 
228 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  47.46 
 
 
235 aa  171  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  39.73 
 
 
235 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  43.18 
 
 
221 aa  170  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  42.08 
 
 
227 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  42.15 
 
 
237 aa  168  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  43.85 
 
 
241 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  45.76 
 
 
236 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  46.82 
 
 
230 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  43.09 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  43.59 
 
 
235 aa  165  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  44.79 
 
 
216 aa  165  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  47.4 
 
 
226 aa  165  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  40.81 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  46.24 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  46.24 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  39.82 
 
 
236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  40.09 
 
 
235 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  40.09 
 
 
235 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  40.09 
 
 
235 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  40.09 
 
 
235 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  40.09 
 
 
235 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  40.1 
 
 
227 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  40.09 
 
 
235 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  40.09 
 
 
235 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  48.84 
 
 
237 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  46.82 
 
 
251 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  48.26 
 
 
237 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  43.93 
 
 
251 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  45.2 
 
 
235 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  44.15 
 
 
219 aa  158  6e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  40.1 
 
 
220 aa  158  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  43.33 
 
 
213 aa  156  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  43.59 
 
 
231 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  38.92 
 
 
243 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  38.66 
 
 
200 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  39.42 
 
 
230 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  41.07 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  41.18 
 
 
224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  43.05 
 
 
238 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  43.95 
 
 
245 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  37.14 
 
 
203 aa  96.3  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.43 
 
 
330 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  37.7 
 
 
228 aa  85.5  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  37.04 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.25 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.85 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.58 
 
 
329 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  29.86 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  32.37 
 
 
394 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  29.45 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  31.97 
 
 
346 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  28.47 
 
 
328 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  29.6 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  23.48 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  29.31 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  29.31 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1964  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.82 
 
 
196 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491162  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  25.29 
 
 
194 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2257  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.53 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0430695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2532  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.53 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2204  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  26.32 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1928  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  26.32 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  0.891038 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.84 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  25.44 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2214  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.37 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.405768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2986  hypothetical protein  33.66 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480275  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3234  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.66 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.35 
 
 
207 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34 
 
 
222 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3516  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  25.55 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960432  normal  0.864738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4810  periplasmic protein-like protein  39.24 
 
 
274 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.008475  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.72 
 
 
202 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  42.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.32 
 
 
191 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3779  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  25.89 
 
 
199 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  33.33 
 
 
206 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  42  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>