85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2807 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2807  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  100 
 
 
230 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.667784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2406  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  91.3 
 
 
230 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2213  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  69.83 
 
 
233 aa  323  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2256  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  68.67 
 
 
234 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.0631375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2531  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  68.67 
 
 
234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2257  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  61.21 
 
 
219 aa  275  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0430695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3777  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  65.83 
 
 
235 aa  275  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2532  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  61.21 
 
 
219 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4770  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  69.4 
 
 
213 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2806  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  64.32 
 
 
215 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3779  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  65.5 
 
 
199 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4260  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  65.96 
 
 
213 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3516  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  65.46 
 
 
227 aa  265  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960432  normal  0.864738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2214  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  72.02 
 
 
217 aa  262  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.405768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2407  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  67.66 
 
 
215 aa  255  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  62.57 
 
 
224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1928  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  60.96 
 
 
222 aa  246  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  0.891038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2204  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  60.96 
 
 
222 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.56 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2572  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  49.4 
 
 
206 aa  175  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  49.4 
 
 
208 aa  174  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2170  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  48.21 
 
 
206 aa  174  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106515  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3134  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  47.62 
 
 
209 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0620467  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  50 
 
 
206 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.86 
 
 
212 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  47.02 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  47.62 
 
 
206 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.45 
 
 
202 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2198  hypothetical protein  45.51 
 
 
173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  42.27 
 
 
201 aa  144  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  41.75 
 
 
201 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  41.05 
 
 
206 aa  141  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  41.05 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1857  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.08 
 
 
201 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308661  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.93 
 
 
222 aa  138  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.95 
 
 
206 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  41.53 
 
 
201 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103073  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  44.87 
 
 
202 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1042  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.31 
 
 
202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115252  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  41.62 
 
 
184 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4117  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  44.85 
 
 
218 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  41.62 
 
 
184 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  38.55 
 
 
200 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  39.77 
 
 
204 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40.12 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  41.82 
 
 
171 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1964  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  41.14 
 
 
196 aa  118  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491162  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.79 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.04 
 
 
194 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1030  hypothetical protein  35.64 
 
 
214 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2641  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.33 
 
 
252 aa  114  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.498867 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.1 
 
 
206 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3780  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.44 
 
 
220 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2713  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.99 
 
 
191 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  44.44 
 
 
191 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2986  hypothetical protein  37.8 
 
 
199 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480275  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3234  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.2 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4810  periplasmic protein-like protein  35.82 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.008475  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.59 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.79 
 
 
330 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  33.06 
 
 
406 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40 
 
 
329 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  35 
 
 
394 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  34.62 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  36.84 
 
 
328 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  37.89 
 
 
251 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  33.12 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  30.81 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.15 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  33.33 
 
 
221 aa  48.9  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  33.68 
 
 
346 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  34 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  37.14 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  37.14 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  37.14 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  36.46 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  37.5 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  31.94 
 
 
200 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.35 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  29.71 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  34.65 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  34.91 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.34 
 
 
229 aa  42  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  35.71 
 
 
251 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  35.71 
 
 
251 aa  41.6  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>