118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1158 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  100 
 
 		 430 aa  859    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  47.18 
 
 		 406 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  38.35 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.75 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.19 
 
 		 329 aa  219  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  44.27 
 
 		 241 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  42.08 
 
 		 203 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  38.1 
 
 		 235 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  40 
 
 		 215 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  38.1 
 
 		 235 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  38.1 
 
 		 235 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  38.1 
 
 		 235 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  41.35 
 
 		 251 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  34.27 
 
 		 216 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  38.1 
 
 		 236 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  33.9 
 
 		 253 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  38.52 
 
 		 229 aa  92  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  33.9 
 
 		 213 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  35.66 
 
 		 235 aa  91.7  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  36.05 
 
 		 235 aa  90.9  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  37.41 
 
 		 235 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  37.41 
 
 		 235 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  37.41 
 
 		 235 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  33.9 
 
 		 230 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  37.86 
 
 		 235 aa  90.9  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  37.41 
 
 		 235 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  36.43 
 
 		 227 aa  90.1  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  36.05 
 
 		 236 aa  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  36.81 
 
 		 213 aa  89.7  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  40.62 
 
 		 221 aa  89  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  38.36 
 
 		 227 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  38.93 
 
 		 237 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  36.23 
 
 		 242 aa  86.7  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  33.9 
 
 		 251 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  36.11 
 
 		 224 aa  86.3  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  34.69 
 
 		 237 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  38.81 
 
 		 226 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  39.34 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  36.05 
 
 		 235 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40.46 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.69 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  35.58 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  35.48 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  36.43 
 
 		 230 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  37.98 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  35.77 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  37.5 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  37.5 
 
 		 241 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  34.29 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  35.38 
 
 		 219 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  35.25 
 
 		 244 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  34.53 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  35.77 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  37.97 
 
 		 253 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  36.03 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  32.39 
 
 		 243 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  33.85 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  37.76 
 
 		 251 aa  69.7  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  35.19 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2807  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.59 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.667784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2406  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.96 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.26 
 
 		 206 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  35.19 
 
 		 200 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2213  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.71 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3777  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.88 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2806  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.6 
 
 		 215 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2256  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.71 
 
 		 234 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.0631375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2531  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.71 
 
 		 234 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4770  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.34 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  31.5 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.85 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.38 
 
 		 207 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  31.19 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2407  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.85 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4260  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.91 
 
 		 213 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  30.58 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1857  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.91 
 
 		 201 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308661  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  32.28 
 
 		 184 aa  54.3  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  32.28 
 
 		 184 aa  54.3  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  34.04 
 
 		 208 aa  54.7  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  30.3 
 
 		 208 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  53.1  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2214  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.81 
 
 		 217 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405768 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  53.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.48 
 
 		 202 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2572  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  31.25 
 
 		 206 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1928  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.57 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  0.891038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2257  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.88 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.68 
 
 		 224 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2204  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.57 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2532  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.88 
 
 		 219 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2170  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  30.36 
 
 		 206 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106515  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  31.93 
 
 		 206 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3134  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  27.69 
 
 		 209 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0620467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4117  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  30.48 
 
 		 218 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  35.09 
 
 		 208 aa  51.2  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2198  hypothetical protein  37.04 
 
 		 173 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>