86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0309 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  73.8 
 
 		 230 aa  339  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  50.46 
 
 		 243 aa  211  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  49.52 
 
 		 226 aa  201  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  42.6 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  48.82 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  50 
 
 		 238 aa  191  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  46.95 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  50.76 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  50.25 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.3 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.05 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  47.37 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  43.11 
 
 		 235 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  42.67 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  42.67 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  42.13 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  40.91 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  44.19 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  41.4 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  41.44 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  41.89 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  43.98 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  47.51 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  40.17 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  40.17 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  40.17 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  40.17 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  45.6 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  40.89 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  40.37 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  42.21 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  41.4 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  44.19 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  44.19 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  46.74 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  43.68 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  44.26 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  43.02 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  43.26 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  45.41 
 
 		 241 aa  158  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  41.63 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  41.63 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  42.54 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  44.07 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  40.22 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  43.26 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  37.23 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  38.21 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  39.29 
 
 		 406 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.88 
 
 		 330 aa  89  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.5 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  36.36 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  35.25 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.58 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.29 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  26.47 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  35.25 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  30.56 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  28.49 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  31.16 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  32.43 
 
 		 328 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  33.65 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  31.07 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  31.58 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  31.58 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.45 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.86 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.33 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.33 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  30.63 
 
 		 171 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.07 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  28.83 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  28.83 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  33.68 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  33.68 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.64 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.73 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2204  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.73 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2713  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.95 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1928  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.73 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  0.891038 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.32 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1030  hypothetical protein  34.38 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2641  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.33 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.73 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>