85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001010 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  85.9 
 
 		 227 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  69.06 
 
 		 220 aa  317  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  50.22 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  51.9 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  56.32 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  55.24 
 
 		 229 aa  228  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  54.12 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  54.64 
 
 		 235 aa  224  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  53.54 
 
 		 235 aa  223  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  50.23 
 
 		 235 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  54.64 
 
 		 235 aa  222  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  50.23 
 
 		 235 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  50.23 
 
 		 235 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  53.85 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  53.85 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  53.85 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  53.85 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  53.03 
 
 		 216 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  47.79 
 
 		 236 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  52.31 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  55.31 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  46.23 
 
 		 242 aa  195  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  47.14 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  45.93 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  50.31 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  50 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  46.56 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  52.94 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  47.34 
 
 		 237 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  47.93 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  49.12 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  50 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  50 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  47.93 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  46.74 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  48.17 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  45.74 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  46.11 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  47.93 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  42.99 
 
 		 243 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  40.1 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  40.1 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  46.33 
 
 		 251 aa  158  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  48.8 
 
 		 245 aa  154  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  43.82 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  38.97 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  43.75 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  40 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.09 
 
 		 330 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.86 
 
 		 430 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  38.52 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.51 
 
 		 329 aa  85.9  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.5 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  30.82 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  35.92 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  29.95 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  36.72 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  30.71 
 
 		 346 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  30.58 
 
 		 328 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  27.74 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  31.85 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.31 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  28.3 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  28.3 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  32.61 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  32.61 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  25.76 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  34.09 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.38 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  34.38 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3780  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.71 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.24 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  30.95 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.27 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  30.59 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.05 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  30.12 
 
 		 171 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2407  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.19 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  30.59 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4770  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.25 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3777  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.13 
 
 		 235 aa  42  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.38 
 
 		 206 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2806  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.25 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>