95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0431 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  76.85 
 
 		 235 aa  358  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  76.85 
 
 		 235 aa  358  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  76.85 
 
 		 235 aa  358  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  76.85 
 
 		 237 aa  358  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  76.39 
 
 		 236 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  75.93 
 
 		 235 aa  354  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  76.85 
 
 		 235 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  76.85 
 
 		 235 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  76.85 
 
 		 235 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  76.85 
 
 		 235 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  74.07 
 
 		 235 aa  347  5e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  72.69 
 
 		 236 aa  344  6e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  73.71 
 
 		 235 aa  343  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  73.15 
 
 		 235 aa  341  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  71.36 
 
 		 235 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  64.14 
 
 		 228 aa  277  7e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  53.59 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  53.03 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  50.23 
 
 		 227 aa  218  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  49.76 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  48.57 
 
 		 219 aa  198  3.9999999999999996e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  46.5 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  45.41 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  47.87 
 
 		 213 aa  188  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  45.71 
 
 		 221 aa  187  8e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  52 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  47.83 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  49.71 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  49.71 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  44.56 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  51.52 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  50.91 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  43.65 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  44.79 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  44.79 
 
 		 244 aa  165  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  47.85 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  47.85 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  47.85 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  46.7 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  40.38 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  47.24 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  47.24 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  44.5 
 
 		 237 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  44.81 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  40.91 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  44.51 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  38.42 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  36.68 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  40.15 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.96 
 
 		 330 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.27 
 
 		 430 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.33 
 
 		 329 aa  92  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  37.11 
 
 		 406 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  32.7 
 
 		 394 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.57 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  32.35 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  34.65 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  29.51 
 
 		 328 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  27.48 
 
 		 346 aa  61.6  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  30.08 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  27.59 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.64 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  29.08 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  29.08 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  33.93 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  33.93 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.19 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1030  hypothetical protein  40.3 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.58 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.58 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.04 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.58 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  27.5 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  30.83 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  30.39 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  31.36 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3777  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.62 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.83 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  30.25 
 
 		 171 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  32.32 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  28.87 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.48 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.17 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2713  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.69 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.51 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2170  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  27.46 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106515  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2572  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  27.46 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  32.32 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3780  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.82 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1964  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.77 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491162  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4260  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.77 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2406  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.14 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0656579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>