71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0895 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  100 
 
 
208 aa  424  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  70.53 
 
 
208 aa  316  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  34.04 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  39.68 
 
 
215 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  33.74 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  32.72 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  34.29 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  32.28 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  28.74 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  29.85 
 
 
226 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  33.33 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.55 
 
 
229 aa  81.3  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  28.14 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  28.14 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.89 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  28.32 
 
 
251 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  31.25 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  39.47 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  28.8 
 
 
237 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  30.95 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  27.57 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  32.08 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  32.08 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  30.34 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  32.72 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  31.4 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  40.4 
 
 
236 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  40.4 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  40.4 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  29.66 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  28.75 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  43.02 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  40.4 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  40.4 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  41.38 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  38.05 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  27.59 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  40.7 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  26.83 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  28.16 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  34.46 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  38.38 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  38.38 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  38.38 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  38.39 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  36.52 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  34.65 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  31.17 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.58 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.8 
 
 
330 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  64.7  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  32.09 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  26.42 
 
 
228 aa  58.2  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  32.2 
 
 
328 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.04 
 
 
430 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  29.73 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  36.75 
 
 
406 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.76 
 
 
241 aa  52  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  34.91 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  30.77 
 
 
394 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  29.91 
 
 
346 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1030  hypothetical protein  32.61 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3780  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.32 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4810  periplasmic protein-like protein  35.21 
 
 
274 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.008475  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  31.47 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.25 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33 
 
 
191 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  33.68 
 
 
251 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2986  hypothetical protein  29.79 
 
 
199 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480275  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  26.03 
 
 
200 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>