95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3763 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  80.71 
 
 		 231 aa  334  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  51.8 
 
 		 243 aa  223  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  48.62 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  52.28 
 
 		 245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  50.26 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  41.56 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  45.37 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  48.21 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  45.05 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  49.23 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  48.96 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  47.89 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  42.6 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  44.62 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  44.62 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  44.62 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  41.06 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  41.35 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  42.36 
 
 		 235 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  42.56 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  39.46 
 
 		 235 aa  170  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  39.91 
 
 		 235 aa  170  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  40.27 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  40.27 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  40.27 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  39.82 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  39.82 
 
 		 235 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  39.82 
 
 		 235 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  39.82 
 
 		 235 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  39.82 
 
 		 235 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  38.42 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  45 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  46.11 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  38.46 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  41.43 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  44.75 
 
 		 219 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  43.48 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  43.89 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  40.38 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  42.02 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  41.55 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  42.62 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  41.24 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  39.05 
 
 		 242 aa  151  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  41.94 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  40.8 
 
 		 219 aa  148  8e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  39.23 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  39.42 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  40.28 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.33 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.85 
 
 		 330 aa  89  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  39.6 
 
 		 406 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.86 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  30.91 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.02 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  28 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  32.86 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  32.89 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  38.66 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  31.16 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  28.65 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.77 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  26.74 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.72 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  30.23 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  30.23 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  29.88 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  29.88 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  31.43 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  33.01 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  35 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  35 
 
 		 201 aa  52  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.65 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.61 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  33.65 
 
 		 171 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.2 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.69 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.91 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4770  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.13 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.73 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2407  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.13 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1030  hypothetical protein  40 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2806  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.13 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.56 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2532  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.48 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  27.71 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2257  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.48 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4260  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.13 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.28 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  33.65 
 
 		 208 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2213  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.96 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2256  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.96 
 
 		 234 aa  42  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.0631375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2531  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.96 
 
 		 234 aa  42  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.85 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>