66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2233 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  35.84 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  35.03 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  34.19 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  35.76 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  33.97 
 
 		 200 aa  91.7  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  33.74 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  38.52 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  29.59 
 
 		 253 aa  88.6  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  34.75 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  37.7 
 
 		 244 aa  85.5  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  37.7 
 
 		 244 aa  85.5  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  30.91 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  33.9 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  32.28 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  34.03 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.75 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.06 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  34.13 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  30.1 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  34.13 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  32.1 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  34.13 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  33.86 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  30.49 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  31.82 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  31.43 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  31.47 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  31.43 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  27.03 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  31.91 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  31.33 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  30.68 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  30.68 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  30.51 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  30.73 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  30.68 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  30.68 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  31.25 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  28.75 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  29.25 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  32.35 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  26.98 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  30.58 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  31.75 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  28.98 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  33.66 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  31 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  34.51 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  28.12 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  37.1 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  24.78 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  31.29 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.22 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  30.43 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  29.75 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  29.79 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.95 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  27.88 
 
 		 394 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1168  hypothetical protein  30.53 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  25.17 
 
 		 329 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.13 
 
 		 430 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  25.71 
 
 		 406 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2713  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.62 
 
 		 191 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.9 
 
 		 191 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>