83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0161 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  68.61 
 
 
227 aa  318  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  69.06 
 
 
227 aa  317  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  51.16 
 
 
235 aa  236  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  52.61 
 
 
236 aa  234  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  50.67 
 
 
235 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  52.07 
 
 
235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  50.7 
 
 
236 aa  230  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  53.77 
 
 
229 aa  228  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  56.38 
 
 
237 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  52.88 
 
 
235 aa  228  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  51.87 
 
 
235 aa  227  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  51.87 
 
 
235 aa  227  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  51.87 
 
 
235 aa  227  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  50.24 
 
 
235 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  50.24 
 
 
235 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  50.24 
 
 
235 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  50.24 
 
 
235 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  55.32 
 
 
235 aa  226  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  49.76 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  50.52 
 
 
228 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  49.75 
 
 
219 aa  203  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  51.7 
 
 
242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  52.11 
 
 
213 aa  196  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  53.98 
 
 
215 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  47.34 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  51.72 
 
 
230 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  51.72 
 
 
253 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  51.72 
 
 
213 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  52.41 
 
 
251 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  49.17 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  48.11 
 
 
237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  45.41 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  46.34 
 
 
226 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  49.44 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  55.77 
 
 
221 aa  180  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  46.49 
 
 
237 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  50.29 
 
 
251 aa  177  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  41.35 
 
 
230 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  47.09 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  47.09 
 
 
229 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  45.6 
 
 
231 aa  168  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  48.66 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  45.55 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  40.1 
 
 
244 aa  158  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  40.1 
 
 
244 aa  158  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  40.1 
 
 
200 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  49.04 
 
 
238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  41.8 
 
 
253 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  40 
 
 
203 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.71 
 
 
329 aa  95.5  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.71 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.15 
 
 
330 aa  92  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  40.14 
 
 
406 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  34.97 
 
 
394 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  30.34 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.04 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  33.33 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  34.03 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  29.37 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  32.23 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  32.88 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  58.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.51 
 
 
207 aa  52  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  30.77 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.89 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  30.77 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  29.7 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  29.7 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  26.11 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.73 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  29 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.7 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  31 
 
 
171 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  26.8 
 
 
206 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.72 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3780  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.84 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.11 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  27.52 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30 
 
 
191 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  30.59 
 
 
204 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  27.52 
 
 
206 aa  41.6  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  24.75 
 
 
206 aa  41.6  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>