89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2257 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2257  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  100 
 
 		 219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2532  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  98.17 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2214  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  83.71 
 
 		 217 aa  359  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3516  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  73.71 
 
 		 227 aa  295  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960432  normal  0.864738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3779  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  70.94 
 
 		 199 aa  294  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2406  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  65.46 
 
 		 230 aa  276  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2807  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  61.21 
 
 		 230 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.667784  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  67.2 
 
 		 224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2204  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  66.67 
 
 		 222 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1928  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  66.67 
 
 		 222 aa  270  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  0.891038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4770  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  67.96 
 
 		 213 aa  264  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2407  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  71.69 
 
 		 215 aa  262  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2806  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  70.91 
 
 		 215 aa  261  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4260  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  67.03 
 
 		 213 aa  257  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2213  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  62.76 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2531  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  63.54 
 
 		 234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2256  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  62.98 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.0631375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3777  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  55.61 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  42.79 
 
 		 207 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  49.4 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  50 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  49.4 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2170  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  46.2 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106515  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2572  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  46.2 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3134  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  47.02 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0620467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.21 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.01 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  41.27 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.58 
 
 		 202 aa  141  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  40.74 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2198  hypothetical protein  44.31 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.09 
 
 		 199 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.37 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  41.56 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  39.77 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1857  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  41.67 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308661  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  44.22 
 
 		 202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4117  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  42.44 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.91 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  41.25 
 
 		 201 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  44.38 
 
 		 171 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1042  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40.61 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.42 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  40.13 
 
 		 184 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  40.13 
 
 		 184 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  32.5 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.49 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2641  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1030  hypothetical protein  37.18 
 
 		 214 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3780  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.33 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1964  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.9 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491162  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.74 
 
 		 191 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3234  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.5 
 
 		 199 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2986  hypothetical protein  38.16 
 
 		 199 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2713  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.74 
 
 		 191 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4810  periplasmic protein-like protein  36.59 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.008475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  37.89 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.04 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  30.5 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  34.57 
 
 		 406 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.88 
 
 		 430 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  36.84 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.57 
 
 		 329 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  35.71 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  35.71 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  36.63 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  34.57 
 
 		 394 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  31.63 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  28.78 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 243 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  30.1 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  31.63 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  30.53 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  31.63 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  31.73 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  27.97 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  30.77 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  29.59 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  31.76 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  34.62 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  29.29 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  30.48 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.68 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  30.48 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  29.25 
 
 		 245 aa  42  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>