107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1080 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  53.27 
 
 		 242 aa  241  7.999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  52.86 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  54.44 
 
 		 229 aa  218  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  50.48 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  52.58 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  54.75 
 
 		 235 aa  203  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  54.1 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  54.1 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  48.36 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  50.76 
 
 		 213 aa  202  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  53.55 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  50.24 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  50.24 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  50.24 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  50.24 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  53.55 
 
 		 235 aa  201  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  53.55 
 
 		 235 aa  201  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  54.14 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  47.26 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  55.93 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  46.95 
 
 		 219 aa  195  3e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  55.31 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  49.52 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  47.42 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  53.98 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  44.44 
 
 		 241 aa  190  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  52 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  46.07 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  48.63 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.27 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.75 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  50.6 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  50.6 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  42.79 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  50.6 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  43.09 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  43.09 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  49.18 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  48.21 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  48.52 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  48.54 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  47.95 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  51.63 
 
 		 243 aa  151  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  41.94 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  43.26 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  42.45 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  47.27 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.56 
 
 		 330 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  39.44 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.26 
 
 		 430 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  39.04 
 
 		 406 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  34.39 
 
 		 394 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  39.68 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.23 
 
 		 329 aa  85.1  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.03 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  38.89 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  32.1 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  33.77 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  34.96 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  33.9 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  27.5 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2407  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.79 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  31.73 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  34.65 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  31.73 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.2 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3134  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  33.66 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0620467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  34.65 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.39 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  29.91 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  33.66 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  29.91 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.72 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4260  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.97 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1928  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.38 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  0.891038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2204  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.38 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2572  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  33.33 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.65 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.36 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2532  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.69 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2170  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  33.66 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106515  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  24.28 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.29 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2806  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.64 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4770  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.64 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2257  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.73 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430695 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  35.23 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2406  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.58 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.43 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2256  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.64 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.0631375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2531  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.64 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1168  hypothetical protein  28.18 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  36.47 
 
 		 390 aa  43.5  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3779  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.29 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2213  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.64 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2214  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.68 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.68 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>