37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1168 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1168  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3009  hypothetical protein  39.18 
 
 
225 aa  55.1  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000764964  hitchhiker  0.00175595 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  30 
 
 
346 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  30.53 
 
 
228 aa  48.5  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  24.46 
 
 
219 aa  48.9  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  27.27 
 
 
328 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2917  hypothetical protein  28.04 
 
 
527 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  26.15 
 
 
225 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  22.88 
 
 
228 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.73 
 
 
330 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  29.14 
 
 
280 aa  45.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.05 
 
 
329 aa  45.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  25.52 
 
 
230 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  23.23 
 
 
235 aa  45.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  41.86 
 
 
456 aa  44.7  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  45.83 
 
 
486 aa  43.9  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  23.81 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  28.18 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  24.83 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  22.47 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  24.83 
 
 
253 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0136  hypothetical protein  48.65 
 
 
352 aa  42.7  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0102155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  26 
 
 
1257 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  22.58 
 
 
235 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  22.58 
 
 
235 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  22.58 
 
 
235 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  22.58 
 
 
235 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  25.83 
 
 
241 aa  42  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3205  hypothetical protein  30.25 
 
 
414 aa  42  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168746  normal  0.0109515 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  25.64 
 
 
633 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  21.94 
 
 
235 aa  42  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  28.12 
 
 
406 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  22.44 
 
 
235 aa  41.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  24.84 
 
 
251 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  26.67 
 
 
212 aa  41.2  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  23.23 
 
 
235 aa  41.6  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  38.81 
 
 
342 aa  41.2  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>