80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3910 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  94.47 
 
 
236 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  88.51 
 
 
235 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  88.51 
 
 
235 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  88.51 
 
 
235 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  88.09 
 
 
235 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  78.72 
 
 
235 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  77.54 
 
 
236 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  74.89 
 
 
235 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  78.92 
 
 
237 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  73.62 
 
 
235 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  71.91 
 
 
235 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  76.85 
 
 
216 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  64.14 
 
 
228 aa  281  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  50.24 
 
 
220 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  53.14 
 
 
227 aa  227  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  49.78 
 
 
229 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  53.85 
 
 
227 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  50.24 
 
 
215 aa  202  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  51.93 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  51.61 
 
 
219 aa  194  8.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  46.04 
 
 
214 aa  191  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  43.1 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  43.4 
 
 
242 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  45.74 
 
 
221 aa  188  8e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  47.53 
 
 
213 aa  186  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  50.56 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  50.56 
 
 
237 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  44.66 
 
 
226 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.33 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  45.08 
 
 
200 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  44.13 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  39.82 
 
 
230 aa  168  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  43 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  40.54 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  43.16 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  44.09 
 
 
230 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  44.09 
 
 
213 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  40.62 
 
 
251 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  40.09 
 
 
244 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  41.59 
 
 
224 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  42.11 
 
 
251 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  47.4 
 
 
245 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  39.66 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  37.09 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  42.95 
 
 
238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  39.42 
 
 
203 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  39.22 
 
 
406 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.41 
 
 
430 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.67 
 
 
330 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.33 
 
 
329 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.78 
 
 
241 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  34.48 
 
 
394 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  30.68 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  40.4 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  39 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  29.23 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  27.78 
 
 
328 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  27.08 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  28.19 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  31.67 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  31.67 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.19 
 
 
194 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.4 
 
 
199 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.4 
 
 
199 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.13 
 
 
207 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  25.53 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  26.47 
 
 
201 aa  46.2  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.97 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.04 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  25.42 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  31.3 
 
 
171 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  26.29 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  25.83 
 
 
200 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1168  hypothetical protein  22.58 
 
 
194 aa  42.4  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  29.69 
 
 
207 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  30.89 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>