93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3263 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  74.04 
 
 
235 aa  380  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  78.03 
 
 
236 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  77.13 
 
 
235 aa  371  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  73.19 
 
 
236 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  71.91 
 
 
235 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  72.77 
 
 
235 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  72.77 
 
 
235 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  72.77 
 
 
235 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  71.91 
 
 
235 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  71.91 
 
 
235 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  71.91 
 
 
235 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  71.06 
 
 
235 aa  362  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  73.54 
 
 
235 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  72.65 
 
 
237 aa  353  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  74.07 
 
 
216 aa  347  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  67.68 
 
 
228 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  61.49 
 
 
229 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  56.7 
 
 
227 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  55.32 
 
 
220 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  54.64 
 
 
227 aa  222  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  54.1 
 
 
215 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  48.57 
 
 
219 aa  202  3e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  49.53 
 
 
219 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  52.13 
 
 
213 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  50.26 
 
 
221 aa  192  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  44.44 
 
 
242 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  44.98 
 
 
241 aa  192  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  48.1 
 
 
226 aa  191  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  48.07 
 
 
214 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.73 
 
 
229 aa  179  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  47.64 
 
 
230 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.2 
 
 
229 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  47.64 
 
 
213 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  47.64 
 
 
253 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  47.64 
 
 
251 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  46.67 
 
 
237 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  43.33 
 
 
251 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  42.36 
 
 
230 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  39.73 
 
 
244 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  39.73 
 
 
244 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  45.64 
 
 
237 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  44.02 
 
 
200 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  42.21 
 
 
231 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  44.1 
 
 
224 aa  158  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  37.33 
 
 
243 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  40.09 
 
 
245 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  35.58 
 
 
253 aa  141  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  37.7 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  40.43 
 
 
203 aa  108  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  41.5 
 
 
330 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  37.62 
 
 
406 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.96 
 
 
329 aa  95.9  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  36.81 
 
 
394 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.66 
 
 
430 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.71 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  35.38 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  27.4 
 
 
208 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  30.66 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  26.98 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  29.66 
 
 
328 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  29.61 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  29.47 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.98 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.08 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.58 
 
 
199 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.58 
 
 
199 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  27.92 
 
 
201 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  27.92 
 
 
201 aa  52.4  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  32.69 
 
 
184 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  32.69 
 
 
184 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.88 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  27.94 
 
 
202 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1030  hypothetical protein  40.3 
 
 
214 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.35 
 
 
191 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  32.2 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.73 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  30.56 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  33.33 
 
 
206 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  33.33 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.33 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3780  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.81 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.68 
 
 
206 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.78 
 
 
206 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  30.83 
 
 
171 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  30.1 
 
 
204 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  28.87 
 
 
208 aa  45.1  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  31.36 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3134  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  29.2 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0620467  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2641  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.91 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.498867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2406  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.77 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2213  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.69 
 
 
233 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.279374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>