90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3596 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  94.47 
 
 
235 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  94.47 
 
 
235 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  94.47 
 
 
235 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  94.47 
 
 
235 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  89.79 
 
 
235 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  90.21 
 
 
235 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  89.79 
 
 
235 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  87.66 
 
 
235 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  77.02 
 
 
235 aa  387  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  79.24 
 
 
236 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  75.32 
 
 
235 aa  384  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  78.92 
 
 
237 aa  377  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  73.19 
 
 
235 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  73.62 
 
 
235 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  76.39 
 
 
216 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  63.13 
 
 
228 aa  277  9e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  52.61 
 
 
220 aa  234  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  57.44 
 
 
227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  58.96 
 
 
229 aa  229  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  51.9 
 
 
227 aa  229  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  52.58 
 
 
215 aa  207  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  50.82 
 
 
219 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  51.61 
 
 
219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  43.4 
 
 
242 aa  192  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  49.74 
 
 
221 aa  191  6e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  43.1 
 
 
241 aa  191  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  45.54 
 
 
214 aa  190  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  48.62 
 
 
213 aa  186  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  46.23 
 
 
226 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  50 
 
 
237 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  50.54 
 
 
237 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  45.87 
 
 
229 aa  178  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  51.19 
 
 
229 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  45.6 
 
 
200 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  50.31 
 
 
213 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  50.31 
 
 
230 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  49.1 
 
 
253 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  43.48 
 
 
231 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  39.82 
 
 
230 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  45.65 
 
 
251 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  40.27 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  42.06 
 
 
224 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  46.81 
 
 
251 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  39.82 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  47.98 
 
 
245 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  37.7 
 
 
243 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  41.24 
 
 
238 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  36.62 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  39.42 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.15 
 
 
330 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.1 
 
 
430 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  39.22 
 
 
406 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  36.11 
 
 
394 aa  92  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.06 
 
 
329 aa  90.1  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.71 
 
 
241 aa  88.6  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  30.49 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  40.4 
 
 
208 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  39 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  30 
 
 
346 aa  65.9  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  28.57 
 
 
328 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  27.37 
 
 
251 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  27.81 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  32.23 
 
 
184 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  32.23 
 
 
184 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.09 
 
 
199 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  27.21 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  27.21 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.09 
 
 
199 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.4 
 
 
194 aa  49.3  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.67 
 
 
206 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.08 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  26.86 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.74 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  31.71 
 
 
206 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.05 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  33.04 
 
 
171 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  31.2 
 
 
207 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.97 
 
 
202 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3134  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  25.49 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0620467  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  27.1 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1030  hypothetical protein  37.31 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  30.69 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  30.69 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2572  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  25.69 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.07 
 
 
191 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  31.65 
 
 
200 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2170  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  26.17 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106515  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  26.54 
 
 
206 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3780  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.82 
 
 
220 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>