83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0889 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  100 
 
 
219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  79.62 
 
 
221 aa  366  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  61.21 
 
 
213 aa  275  6e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  51.43 
 
 
235 aa  207  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  47.25 
 
 
236 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  48.57 
 
 
235 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  53.23 
 
 
235 aa  202  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  47.91 
 
 
235 aa  201  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  50.99 
 
 
214 aa  201  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  52.69 
 
 
235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  52.69 
 
 
235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  49.3 
 
 
235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  48.57 
 
 
216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  51.61 
 
 
236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  46.95 
 
 
215 aa  195  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  51.61 
 
 
235 aa  194  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  51.61 
 
 
235 aa  194  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  51.61 
 
 
235 aa  194  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  51.61 
 
 
235 aa  194  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  49.05 
 
 
237 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  47 
 
 
235 aa  192  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  42.34 
 
 
242 aa  191  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  47.66 
 
 
229 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  50.27 
 
 
227 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  47.66 
 
 
229 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  45.05 
 
 
226 aa  185  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  49.44 
 
 
220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  46.67 
 
 
229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  50.58 
 
 
213 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  50.58 
 
 
253 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  50 
 
 
230 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  48.39 
 
 
228 aa  177  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  50 
 
 
227 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  46.24 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  47.28 
 
 
241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  45.08 
 
 
237 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  47.09 
 
 
251 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  44.56 
 
 
237 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  40.87 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  44.15 
 
 
244 aa  158  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  44.15 
 
 
244 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  42.11 
 
 
200 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  40.8 
 
 
230 aa  148  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  43.98 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  42.04 
 
 
243 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  39.67 
 
 
231 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  41.48 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  40.54 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  37.3 
 
 
238 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  40.94 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.76 
 
 
330 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  33.76 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  32.28 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  42.24 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.11 
 
 
430 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  31.94 
 
 
394 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.58 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.59 
 
 
329 aa  71.6  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  29.14 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  33.66 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  28.93 
 
 
328 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  31.33 
 
 
251 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  32.11 
 
 
201 aa  51.6  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  32.11 
 
 
201 aa  51.6  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  29.51 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  29.19 
 
 
206 aa  48.5  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  29.19 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.11 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  30.69 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  30.69 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.26 
 
 
206 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  35.42 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  33.03 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.85 
 
 
194 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  26.28 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.81 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  24.39 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  31.78 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  31.4 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2807  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.71 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.667784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1030  hypothetical protein  34.33 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.48 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  31.31 
 
 
202 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>