79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2663 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  44.39 
 
 		 243 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  45.41 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  41.56 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  46.27 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  46.27 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  46.89 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  45.77 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  44.78 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  42.86 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  43.12 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40 
 
 		 229 aa  175  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.55 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  39.04 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  42.93 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  42.42 
 
 		 237 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  46.29 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  37.1 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  35.45 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0161  hypothetical protein  41.8 
 
 		 220 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  44.19 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001010  hypothetical protein  38.97 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  35.58 
 
 		 235 aa  141  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  40.46 
 
 		 213 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1372  hypothetical protein  35.32 
 
 		 200 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0363  hypothetical protein  34.88 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  35.78 
 
 		 235 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0379  hypothetical protein  35.34 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0472  hypothetical protein  34.84 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  37.09 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  37.09 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  37.09 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  37.09 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  37.04 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  37.04 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  37.04 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2827  periplasmic protein-like protein  43.53 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.789091  normal  0.0661968 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  36.62 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  46.98 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1448  hypothetical protein  39.38 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  41.48 
 
 		 219 aa  130  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  41.07 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  41.07 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  40 
 
 		 215 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  33.63 
 
 		 235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  36.96 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  33.66 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  39.51 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  36.68 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2233  hypothetical protein  29.59 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.72 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.51 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  34.97 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.97 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  29.09 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  31.25 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  34.25 
 
 		 394 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  37.5 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  28.23 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.51 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0895  OmpA/MotB  37.89 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000873981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  29.47 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  27.46 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  26.13 
 
 		 184 aa  52.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  26.13 
 
 		 184 aa  52.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  30.84 
 
 		 199 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.91 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  26.47 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  27.95 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2406  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.62 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.05 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.71 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.18 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.3 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2204  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.27 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1928  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  27.27 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  0.891038 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  30.47 
 
 		 171 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  30.1 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  29.13 
 
 		 206 aa  42  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>