108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3902 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  100 
 
 		 206 aa  423  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  81.64 
 
 		 207 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  84.47 
 
 		 206 aa  345  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  81 
 
 		 208 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3134  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  81.32 
 
 		 209 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0620467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2572  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  74.02 
 
 		 206 aa  310  6.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2170  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  72.2 
 
 		 206 aa  308  5e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106515  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.34 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.77 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  49.11 
 
 		 212 aa  187  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3777  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  47.76 
 
 		 235 aa  185  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2257  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  45.05 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2214  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  51.79 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2532  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  44.55 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  45.21 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2256  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  48.54 
 
 		 234 aa  171  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.0631375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2531  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  48.54 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  47.96 
 
 		 201 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2406  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  50.31 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4260  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  49.69 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2807  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  50 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.667784  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1857  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.94 
 
 		 201 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308661  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2213  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  50 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2806  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  44.78 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4770  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  47.06 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2407  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  49.69 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3779  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.3 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  49.69 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3516  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.75 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960432  normal  0.864738 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  45.21 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1042  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  49.41 
 
 		 202 aa  160  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1928  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  48.45 
 
 		 222 aa  160  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  0.891038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2204  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  48.45 
 
 		 222 aa  160  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  44.68 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  44.81 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2198  hypothetical protein  51.22 
 
 		 173 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2641  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  45.88 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498867 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  41.8 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  43.01 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  43.01 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  47.5 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40.62 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4117  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  45 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.11 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  45.34 
 
 		 171 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  37.63 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.68 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  38.01 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  38.01 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.75 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1964  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.54 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491162  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1030  hypothetical protein  32.8 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3780  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.84 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2986  hypothetical protein  37.42 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3234  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  36.2 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.58 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2713  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.67 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4810  periplasmic protein-like protein  34.62 
 
 		 274 aa  88.6  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.008475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  37.76 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.65 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  31.5 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  35.79 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.3 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  34.02 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  35.05 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  37.65 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  37.65 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  33.61 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.01 
 
 		 329 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  35.45 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  36.79 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  37.04 
 
 		 394 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  31.5 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  32.2 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  36.59 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  29.52 
 
 		 430 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0308  hypothetical protein  28.47 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0293189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3596  hypothetical protein  28.05 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  34.69 
 
 		 406 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  33.63 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  31.53 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02470  periplasmic protein  33.33 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  29.25 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  33.66 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.65 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4322  hypothetical protein  27.04 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  32.26 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.69 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  28.47 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0379  hypothetical protein  27.01 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3647  hypothetical protein  27.01 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0377  hypothetical protein  27.01 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.560354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4144  hypothetical protein  28.47 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  28.17 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4009  hypothetical protein  27.44 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3987  hypothetical protein  27.44 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  31.53 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4103  hypothetical protein  27.44 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.898046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  31.13 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3910  hypothetical protein  27.44 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>