99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0454 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0454  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  100 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418217  normal  0.164398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2572  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  48.8 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2146  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  52.02 
 
 
206 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3902  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  50.87 
 
 
206 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5218  hypothetical protein  53.57 
 
 
208 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3279  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  45.32 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.824885  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3134  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  51.79 
 
 
209 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0620467  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2170  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  52.38 
 
 
206 aa  185  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106515  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0872  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40.76 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.0975549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1726  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  47.25 
 
 
202 aa  157  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0686  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  46.25 
 
 
204 aa  154  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.463723  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4117  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  43 
 
 
218 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4440  transglutaminase-like cysteine peptidase, BTLCP  44.07 
 
 
200 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1934  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.5 
 
 
202 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1857  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.71 
 
 
201 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308661  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2198  hypothetical protein  46.39 
 
 
173 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0957  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.07 
 
 
212 aa  148  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.11 
 
 
201 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103073  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1220  hypothetical protein  40.1 
 
 
201 aa  145  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1042  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  45.66 
 
 
202 aa  144  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115252  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0778  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.26 
 
 
206 aa  144  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1259  hypothetical protein  39.6 
 
 
201 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.344293  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2641  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  41.67 
 
 
252 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.498867 
 
 
-
 
NC_004310  BR2133  hypothetical protein  39.29 
 
 
206 aa  142  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2049  hypothetical protein  39.29 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2807  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  41.67 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.667784  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3777  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  46.05 
 
 
235 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3481  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.11 
 
 
206 aa  136  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00539194  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2213  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  39.39 
 
 
233 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0197  hypothetical protein  39.88 
 
 
171 aa  134  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2406  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40.2 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2257  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.35 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0430695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3779  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40.44 
 
 
199 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4530  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.42 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3516  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40.44 
 
 
227 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960432  normal  0.864738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2214  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.86 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.405768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2532  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.86 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4265  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40.85 
 
 
199 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2256  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.71 
 
 
234 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.0631375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4770  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40.99 
 
 
213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2531  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  43.05 
 
 
234 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1928  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.79 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  0.891038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2204  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.79 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0970  hypothetical protein  40.35 
 
 
184 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4260  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  38.98 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1029  hypothetical protein  40.35 
 
 
184 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1819  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40 
 
 
224 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2806  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40.26 
 
 
215 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1351  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  42.04 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2407  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  40.26 
 
 
215 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2986  hypothetical protein  37.69 
 
 
199 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480275  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1964  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  37.58 
 
 
196 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491162  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3234  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  35.5 
 
 
199 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1030  hypothetical protein  37.58 
 
 
214 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3780  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  31.8 
 
 
220 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2379  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.64 
 
 
191 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906047  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2713  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.76 
 
 
191 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4810  periplasmic protein-like protein  36.17 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.008475  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7156  hypothetical protein  32.28 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3353  hypothetical protein  33.04 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.526541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1558  hypothetical protein  36.19 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111516  normal  0.164142 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0003  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.54 
 
 
329 aa  55.1  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1879  hypothetical protein  34.95 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0183  hypothetical protein  36.27 
 
 
253 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1420  hypothetical protein  40 
 
 
394 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.548403  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2244  hypothetical protein  34.62 
 
 
328 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0182  hypothetical protein  36.27 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234882  normal  0.614975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0164  hypothetical protein  36.27 
 
 
213 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000051589 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1308  transglutaminase domain protein  31.86 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809484  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2758  periplasmic protein-like protein  32.65 
 
 
346 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202545  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1975  hypothetical protein  32.23 
 
 
406 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.495543  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1153  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  34.38 
 
 
330 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5065  hypothetical protein  33.64 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333704  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0161  periplasmic protein  29.38 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.494989  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0130  hypothetical protein  26.34 
 
 
251 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1080  periplasmic protein  30.72 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1809  periplasmic protein-like protein  34.65 
 
 
226 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0791  periplasmic protein  35.24 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000013365  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1218  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  32.71 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45920  hypothetical protein  33.98 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2096  hypothetical protein  32.41 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0209  hypothetical protein  33.68 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2663  hypothetical protein  35.05 
 
 
253 aa  45.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.918683  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1158  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  28.69 
 
 
430 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0566  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33.06 
 
 
241 aa  45.4  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3057  transglutaminase family protein cysteine peptidase BTLCP  33 
 
 
229 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0431  hypothetical protein  24.58 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0309  hypothetical protein  31.73 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1230  periplasmic protein-like protein  28.65 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3263  hypothetical protein  31 
 
 
235 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.310609  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0859  hypothetical protein  34 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0890  hypothetical protein  34 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1347  periplasmic protein  33.03 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3895  hypothetical protein  33.01 
 
 
237 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762236  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07088  hypothetical protein  32 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2112  Sulfate adenylyltransferase, small subunit  33.33 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.900528  normal  0.825144 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0889  periplasmic protein  33.02 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0471962  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0168  hypothetical protein  25.71 
 
 
208 aa  42  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00332877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3763  hypothetical protein  28.85 
 
 
230 aa  41.6  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>