More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0456 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0456  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 
252 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
266 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057766  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  32.49 
 
 
257 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
280 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.63 
 
 
284 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
263 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
281 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
283 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.47 
 
 
269 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947992  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.75 
 
 
271 aa  95.5  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  30.22 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1200  transmembrane permease ABC transporter protein  30.33 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.441856  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0457  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  26.91 
 
 
258 aa  92  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.15 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.101401  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.45 
 
 
280 aa  91.3  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133558  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  29.87 
 
 
257 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  31.25 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.81 
 
 
275 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  31.13 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3330  ABC transporter membrane spanning protein  23.87 
 
 
295 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4937  ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 
268 aa  89  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
268 aa  89  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
278 aa  88.6  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  30.73 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146122 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4517  ABC transporter, permease  27.69 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4923  ABC transporter, permease protein  27.69 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.1 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.1 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.92 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4677  ABC transporter permease  27.18 
 
 
268 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4536  ABC transporter, permease  27.18 
 
 
268 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5038  ABC transporter permease  27.18 
 
 
268 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4902  ABC transporter, permease protein  27.18 
 
 
268 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  27.27 
 
 
298 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1818  ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 
263 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.493092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4903  ABC transporter, permease protein  27.18 
 
 
268 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.27 
 
 
277 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
279 aa  85.9  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.55 
 
 
293 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.877762  normal  0.739003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
263 aa  85.5  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243564  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
254 aa  85.5  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2355  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  28.17 
 
 
274 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214574  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.1 
 
 
293 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324199  normal  0.863766 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0335  ABC transporter, permease protein  26.15 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2103  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.28 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498595  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
277 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
257 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0826963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.73 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.19 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  32.04 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.1 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  24.14 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.83 
 
 
282 aa  79  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
247 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
532 aa  78.6  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.75 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.35 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  29.72 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3334  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.5 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.227064  normal  0.190195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4677  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.12 
 
 
279 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03360  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  29.25 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2566  ABC transporter, membrane subunit  26.8 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.85 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.5 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  23.76 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  23.76 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  23.76 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  23.76 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  23.76 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  23.76 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6067  ABC transporter permease  29.44 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>