83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3747 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  176  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  90.59 
 
 		 85 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  72.62 
 
 		 84 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  70.24 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  70.24 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3423  hypothetical protein  51.85 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  51.85 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  50.77 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  47.3 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  45.68 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  53.23 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  45.07 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1968  hypothetical protein  39.74 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1995  hypothetical protein  39.74 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0383118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  43.42 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  36.08 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  43.66 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2220  hypothetical protein  42.31 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  41.03 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  41.98 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  39.74 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3352  hypothetical protein  40.91 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  41.03 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.809996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1281  hypothetical protein  44.78 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  38.04 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  41.3 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  41.57 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  35.96 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  41.43 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0524  hypothetical protein  35.37 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  43.66 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3907  putative cytoplasmic protein  41.1 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  37.08 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  37.08 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  47.27 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  35.71 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  35.8 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  41.77 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  41.77 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  40.32 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  40.32 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  37.04 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  38.03 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  41.18 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  47.5 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  39.71 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  38.33 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  38.33 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  39.66 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  32.94 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  37.66 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  57.14 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  54.55 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  32.29 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  36.84 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1314  CopG domain protein DNA-binding domain protein  49.12 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153702 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2652  hypothetical protein  37.7 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  54.55 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  45.83 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  56.25 
 
 		 116 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  54.55 
 
 		 105 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  47.22 
 
 		 98 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  51.43 
 
 		 77 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  36.62 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  36.62 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2415  hypothetical protein  45.61 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.612018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  36.62 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2046  CopG domain protein DNA-binding domain protein  45.61 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.30352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  44.44 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  51.52 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2194  hypothetical protein  51.35 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  45.71 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1008  hypothetical protein  45.24 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  45.71 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  45.71 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0265  hypothetical protein  57.58 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  40.82 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  34.92 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  47.5 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  30.39 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  45.45 
 
 		 105 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>