28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1008 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1008  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1314  CopG domain protein DNA-binding domain protein  57.5 
 
 		 80 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0787  CopG/DNA-binding domain-containing protein  57.14 
 
 		 82 aa  90.1  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2415  hypothetical protein  56.25 
 
 		 80 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.612018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2046  CopG domain protein DNA-binding domain protein  56.25 
 
 		 80 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.30352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0154  hypothetical protein  54.88 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0264  hypothetical protein  53.66 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1870  hypothetical protein  45.59 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2757  hypothetical protein  49.12 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  48.84 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  48.84 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  48.84 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  48.84 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  45.28 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  40.98 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000179699  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2196  hypothetical protein  38.81 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0130  hypothetical protein  38.81 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  43.64 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  41.07 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  41.67 
 
 		 85 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  38.18 
 
 		 98 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  43.48 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  45.24 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  45.65 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2271  hypothetical protein  36.07 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.941598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  39.34 
 
 		 79 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>