75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31940 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  207  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  47.37 
 
 
106 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  43.01 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  64 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  65.96 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3099  hypothetical protein  63.83 
 
 
93 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  43.37 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3498  hypothetical protein  61.22 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  43.94 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  56.82 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  40.24 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  42.42 
 
 
101 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  50.79 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  60.47 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  37.5 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  37.5 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  39.53 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  34.34 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  39.53 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  38.37 
 
 
94 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  39.47 
 
 
90 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  55.32 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  37.88 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  37.88 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  42.86 
 
 
101 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  36.73 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  38.64 
 
 
101 aa  50.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  34.34 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  42.19 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  43.08 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  40.26 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  34.07 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  34.07 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  40.26 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  41.46 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  32.99 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  33.7 
 
 
106 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  35.48 
 
 
85 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  43.08 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  43.24 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  32.63 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  36.11 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  33.68 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  40.38 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  32.29 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  42.22 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1007  hypothetical protein  29.9 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  33.72 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  41.67 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  41.67 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  55.88 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1008  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  43.18 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  35 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  44.44 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  35.19 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  35.19 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  35.19 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  37.68 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  43.24 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3169  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3632  hypothetical protein  39.13 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596727  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  46.34 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  39.47 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  36.36 
 
 
104 aa  41.2  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  42.11 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  28.26 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4942  hypothetical protein  36.25 
 
 
100 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.809996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>