87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2284 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  57.43 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  51.95 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  48.1 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  52.78 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  44.83 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  48.05 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  52.05 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  48.05 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  63.83 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  58 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  56 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  56 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  44.29 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3099  hypothetical protein  57.14 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  52.08 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  45.83 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  45.83 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  55.32 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  47.37 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  47.37 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  47.37 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  46.03 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  47.46 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  36.67 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  35.85 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0265  hypothetical protein  50.98 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  37.76 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  54.55 
 
 		 92 aa  50.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  38.71 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  48.94 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  52.17 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  48.94 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  54.76 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  53.49 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  52.38 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  36.27 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  32.39 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  38.24 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  45.59 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  46.81 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  56.1 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  38.24 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  36.59 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  56.1 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6776  hypothetical protein  36.96 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102371  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  52.38 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5509  hypothetical protein  53.06 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  52.78 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  54.55 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  58.14 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  40.74 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  48.57 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  34.83 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  42.65 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  47.37 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  46.67 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  46.15 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  44.44 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  39.08 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3632  hypothetical protein  47.22 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3925  hypothetical protein  53.12 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  44.44 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  30.49 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  44.74 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  38 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  51.52 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  48.57 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  43.59 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  34.34 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  47.06 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1007  hypothetical protein  40.43 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  28.75 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4935  hypothetical protein  43.9 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  28.36 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  44.74 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4374  hypothetical protein  35.11 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00628463  normal  0.40672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>