68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2294 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  200  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  200  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  200  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  47.56 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  47.37 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  47.37 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  49.4 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  43.56 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  46.43 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  45.45 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  58.82 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  49.28 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  48.1 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3498  hypothetical protein  43.42 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  43.75 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  40.62 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  50 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  55.32 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  51.02 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  37.8 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  49.12 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  53.19 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  53.19 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  45.61 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  47.37 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  47.37 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  48.44 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  43.4 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  42.71 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  41.46 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3099  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  56.25 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  38.36 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  38.36 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  36.14 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  39.73 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  40.85 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  51.02 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  44.68 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  45.45 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  37.04 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  47.92 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  34.21 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  39.39 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  39.39 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4286  hypothetical protein  38.16 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0165721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  37.5 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  41.86 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2652  hypothetical protein  34.48 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  44.44 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  43.59 
 
 		 85 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  43.59 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  41.86 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0265  hypothetical protein  45.65 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  43.24 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  54.29 
 
 		 79 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  43.75 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  35.19 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  34.25 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4513  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  51.43 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  45.71 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  44.74 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  47.37 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  34.25 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  45.71 
 
 		 79 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>