54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0642 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  193  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  66.13 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  39.06 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  44.44 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  45.21 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  48.53 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  48.53 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  48.53 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  48.53 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  39.19 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  39.39 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  38.71 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  38.71 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  37.84 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  40.79 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  45.45 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  45.45 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  45.45 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  39.39 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  38.16 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  31.51 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  57.58 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  41.07 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  41.27 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  46 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  39.44 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  35.53 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  39.44 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  36.11 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  33.78 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3632  hypothetical protein  48.65 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  42.03 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  36.62 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  56.25 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  47.5 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  45.95 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  30.65 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1169  hypothetical protein  39.34 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.898499  normal  0.371685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  34.92 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  34.33 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3498  hypothetical protein  35.71 
 
 		 100 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  34.18 
 
 		 103 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  48.48 
 
 		 79 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1271  hypothetical protein  35.14 
 
 		 109 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  45.95 
 
 		 80 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  33.78 
 
 		 104 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  41.46 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  41.67 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  31.94 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  36.23 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  38.64 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3925  hypothetical protein  47.22 
 
 		 82 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0265  hypothetical protein  43.48 
 
 		 112 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>