66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4359 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  81.25 
 
 
80 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  81.01 
 
 
81 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  77.5 
 
 
80 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  76.92 
 
 
79 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  74.36 
 
 
79 aa  120  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  70.15 
 
 
80 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3632  hypothetical protein  58.54 
 
 
82 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596727  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  61.25 
 
 
80 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3925  hypothetical protein  53.66 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  52.63 
 
 
77 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  52.63 
 
 
78 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  61.76 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3169  hypothetical protein  64.71 
 
 
86 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  59.46 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  40.85 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  59.46 
 
 
92 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  58.82 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  48.94 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  48.94 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  53.06 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  57.14 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  53.06 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  39.68 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  58.82 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  54.05 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  55 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  54.05 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0642  hypothetical protein  57.58 
 
 
95 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.343821  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  47.92 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  52.94 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  40.32 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  53.85 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  56.1 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  43.24 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  55.88 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3435  hypothetical protein  42.19 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615538  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  36.51 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0091  hypothetical protein  48.57 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.77032 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  47.5 
 
 
85 aa  42.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  54.55 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  45.1 
 
 
79 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1491  hypothetical protein  51.43 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  41.54 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  58.62 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2536  hypothetical protein  52.63 
 
 
108 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1634  hypothetical protein  45.71 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2273  hypothetical protein  44.44 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  44.44 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  45.65 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4930  hypothetical protein  48.98 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  42.42 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0189  hypothetical protein  44.44 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  55.17 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  48.65 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  46.88 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2105  hypothetical protein  42.86 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000002079  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  53.57 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  53.57 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  43.75 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  45.71 
 
 
96 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  45.71 
 
 
96 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  45.71 
 
 
96 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  30.26 
 
 
105 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2250  hypothetical protein  53.33 
 
 
114 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>