38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2922 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  90 
 
 		 80 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  87.5 
 
 		 80 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  83.33 
 
 		 79 aa  135  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  83.33 
 
 		 79 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  81.01 
 
 		 79 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  70.67 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3632  hypothetical protein  60.26 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  61.84 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3925  hypothetical protein  53.85 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  56.58 
 
 		 77 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  52.63 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  64.1 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3169  hypothetical protein  70.59 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  62.16 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  59.46 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  60 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  59.46 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  59.46 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  46.81 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  46.81 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  55.88 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  44.07 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  38.1 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  54.05 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  46.94 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  43.18 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  46.94 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  46.94 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  44.44 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  52.94 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  40.91 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  47.22 
 
 		 79 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3498  hypothetical protein  47.06 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  57.58 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  47.5 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1007  hypothetical protein  51.52 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>