53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2605 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2605  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0504919  hitchhiker  0.00914648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2867  hypothetical protein  90 
 
 		 80 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2922  hypothetical protein  90 
 
 		 81 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4359  hypothetical protein  81.25 
 
 		 79 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.905449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1774  hypothetical protein  79.75 
 
 		 79 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2595  hypothetical protein  81.01 
 
 		 79 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0610433  normal  0.1614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1580  hypothetical protein  67.11 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.948957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3915  hypothetical protein  61.84 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0518092  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3632  hypothetical protein  60.26 
 
 		 82 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3925  hypothetical protein  56.41 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5333  hypothetical protein  57.14 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4921  hypothetical protein  53.25 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3169  hypothetical protein  70.59 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  64.86 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  64.86 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  63.89 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  63.89 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1214  hypothetical protein  43.42 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.314538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  58.82 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  60 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  54.76 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  54.76 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  58.82 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  40.98 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  55.88 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  54.05 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3975  hypothetical protein  47.62 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  40.3 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  51.52 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  60.61 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  46 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0664  hypothetical protein  46.67 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  55.88 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  51.52 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  51.52 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1007  hypothetical protein  51.52 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  54.55 
 
 		 101 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  51.35 
 
 		 69 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  51.35 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1361  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.302486  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  51.43 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1999  hypothetical protein  51.43 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  51.43 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  51.43 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5047  hypothetical protein  45.1 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2885  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291569  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  46.88 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  44.44 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  45.95 
 
 		 90 aa  40  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0287  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  45.95 
 
 		 90 aa  40  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>